El Dr. Charles A. Ofria es profesor en el Departamento de Ciencias de la Computación e Ingeniería de la Universidad Estatal de Michigan , director del Laboratorio de Evolución Digital (DEvo) allí y director del Centro BEACON para el Estudio de la Evolución en Acción. Es hijo del fallecido Charles Ofria, [3] quien desarrolló el primer programa de gestión de talleres totalmente integrado para la industria de reparación de automóviles. Ofria asistió a Stuyvesant High School y se graduó de Ward Melville High School en 1991. Obtuvo una licenciatura en Ciencias de la Computación, Matemáticas Puras y Matemáticas Aplicadas de la Universidad de Stony Brook.en 1994 y un Ph.D. en Computación y Sistemas Neurales del Instituto de Tecnología de California en 1999. La investigación de Ofria se centra en la interacción entre la informática y la evolución darwiniana. [4]
Carlos Ofria | |
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Nació | Nueva York, NY (Estados Unidos) | 13 de diciembre de 1973
Ciudadanía | Estados Unidos |
alma mater | Universidad de Stony Brook (BS, 1994) Instituto de Tecnología de California (Ph.D., 1999) |
Conocido por | Evolución digital , Avida |
Premios | Premio Withrow Distinguished Scholar (2006, 2016) [1] Premio NSF CAREER (2007) Premio Withrow Teaching Excellence Award (2010) [2] |
Carrera científica | |
Campos | Ciencias de la Computación, Biología Evolutiva |
Instituciones | Universidad del estado de michigan |
Asesor de doctorado | Christoph Adami |
Otros asesores académicos | Richard Lenski |
Sitio web | www |
Ofria es uno de los diseñadores de Avida , una plataforma de software de vida artificial para estudiar la biología evolutiva de programas informáticos que se auto-replican y evolucionan ( organismos digitales , véase también Simuladores de organismos digitales ). Avida se ha utilizado ampliamente para estudiar los procesos básicos que subyacen a la evolución darwiniana. [5] Avida está en desarrollo activo en el Laboratorio de Evolución Digital de Ofria en la Universidad Estatal de Michigan y fue diseñado originalmente por Ofria, Chris Adami y C. Titus Brown en Caltech en 1993.
Honores
Ofria recibió el NSF Career Award en 2007 [6] y el Withrow Excellence Award for Excellence in Teaching en 2010 [7] y para Excellence in Research en 2006 y 2016. [8] También fue ganador en 2017 del William J. Beal Premio Facultad Sobresaliente. [9]
Publicaciones de revistas representativas
- Clune J, Pennock RT, Ofria C, Lenski RE (2012) La ontogenia tiende a recapitular la filogenia en los organismos digitales " The American Naturalist 180: E54-E63. ( Pdf )
- Clune J, Goldsby HJ, Ofria C y Pennock RT (2011) Presiones selectivas para una focalización precisa del altruismo: evidencia de la evolución digital para aspectos difíciles de probar de la teoría de la aptitud inclusiva. Actas de la Royal Society. 278: 666-674. ( PDF )
- Clune J, Stanley KO, Pennock RT, Ofria C (2011) Sobre el desempeño de la codificación indirecta en el continuo de regularidad. Transacciones IEEE sobre Computación Evolutiva. 15 (3): 346-367. ( PDF )
- Clune J, Misevic D, Ofria C, Lenski RE, Elena SF y Sanjuán R. La selección natural no optimiza las tasas de mutación para la adaptación a largo plazo en paisajes de fitness accidentados [10]
- Ofria C, Huang W y Torng E. Sobre la evolución gradual de la complejidad y la aparición repentina de características complejas [11]
- Elena SF, Wilke CO, Ofria C y Lenski RE. Efectos del tamaño de la población y la tasa de mutación sobre la evolución de la robustez mutacional [12]
- Ostrowski E, Ofria C y Lenski RE, Especialización ecológica y deterioro adaptativo en organismos digitales [13]
- Lenski RE, Barrick JE, Ofria C. Equilibrio entre robustez y evolución [14]
- Misevic D, Ofria C y Lenski RE. La reproducción sexual reforma la arquitectura genética de los organismos digitales [15]
Publicaciones científicas seleccionadas con Avida
- RE Lenski , C. Ofria, TC Collier, C. Adami (1999). Complejidad genómica, robustez e interacciones genéticas en organismos digitales. Nature 400: 661-664. Resumen
- C. Adami , C. Ofria y TC Collier (2000). Evolución de la complejidad biológica. "Actas de la Academia Nacional de Ciencias" 97 : 4463-4468. Resumen
- CO Wilke, JL Wang, C. Ofria, RE Lenski y C. Adami (2001). La evolución de los organismos digitales con una alta tasa de mutación conduce a la supervivencia de los más planos. Nature 412: 331-333 Resumen .
- RE Lenski , C. Ofria, RT Pennock y C. Adami (2003). El origen evolutivo de las características complejas. Nature 423: 139-145. Resumen
- SS Chow, CO Wilke, C. Ofria, RE Lenski y C. Adami (2004). Radiación adaptativa de la competencia de recursos en organismos digitales. Science 305: 84-86 Resumen .
Referencias
- ^ "Ofria y Owen reciben premios Withrow" . Universidad Estatal de Michigan . Archivado desde el original el 4 de junio de 2016 . Consultado el 2 de octubre de 2017 .
- ^ "Ofria y Tan reciben premios Withrow" . Universidad Estatal de Michigan . Archivado desde el original el 25 de marzo de 2015 . Consultado el 2 de octubre de 2017 .
- ^ "Charles Ofria (senior)" . FamilyCar.com. Archivado desde el original el 8 de febrero de 2013 . Consultado el 11 de diciembre de 2011 .
- ^ Ciencias de la computación Universidad estatal de Michigan
- ^ "Prueba de Darwin" . Revista Discover . Febrero de 2005.
- ^ "Charles Ofria recibe el premio NSF CAREER Award" . Universidad Estatal de Michigan . 2007. Archivado desde el original el 6 de abril de 2012.
- ^ "Ofria y Tan reciben premios Withrow" . 2010.
- ^ "Jain, Ofria y Stirewalt ganan premios Withrow" . 2006.
- ^ "Premios de la facultad destacada de William J. Beal 2017" . 2017.
- ^ Clune, J; Misevic, D; Ofria, C; Lenski, RE; Elena, SF; Sanjuán, R (2008). "La selección natural no optimiza las tasas de mutación para la adaptación a largo plazo en paisajes de fitness accidentados" . PLOS Biología Computacional . 4 (9): e1000187. Código bibliográfico : 2008PLSCB ... 4E0187C . doi : 10.1371 / journal.pcbi.1000187 . PMC 2527516 . PMID 18818724 .
- ^ Ofria, Charles; Huang, Wei; Torng, Eric (2007). "Sobre la evolución gradual de la complejidad y la aparición repentina de características complejas". Vida artificial . 14 (3): 255–263. doi : 10.1162 / artl.2008.14.3.14302 . PMID 18489251 . S2CID 2010637 .
- ^ Elena, Santiago F .; Wilke, Claus O .; Ofria, Charles; Lenski, Richard E. (2007). "Efectos del tamaño de la población y la tasa de mutación sobre la evolución de la robustez mutacional" . Evolución . 61 (3): 666–674. doi : 10.1111 / j.1558-5646.2007.00064.x . PMID 17348929 . S2CID 14353070 .
- ^ Ostrowski, Elizabeth A .; Ofria, Charles; Lenski, Richard E. (2007). "Especialización ecológica y deterioro adaptativo en organismos digitales". El naturalista estadounidense . 169 (1): E1-20. doi : 10.1086 / 510211 . JSTOR 10.1086 / 510211 . PMID 17206577 . S2CID 15024491 .
- ^ Lenski, RE; Barrick, JE; Ofria, C (2006). "Equilibrio entre robustez y evolución" . PLOS Biología . 4 (12): e428. doi : 10.1371 / journal.pbio.0040428 . PMC 1750925 . PMID 17238277 .
- ^ Misevic, Dusan; Ofria, Charles; Lenski, Richard E. (2005). "La reproducción sexual reforma la arquitectura genética de los organismos digitales" . Actas de la Royal Society B: Ciencias Biológicas . 273 (1585): 457–464. doi : 10.1098 / rspb.2005.3338 . PMC 1560214 . PMID 16615213 .
enlaces externos
- Software Avida
- Proyecto Avida-ED , dirigido por Robert T. Pennock
- El sitio de un desarrollador de Avida
- El origen evolutivo de las características adaptativas complejas 2003 Nature Paper
- 2010 Podcast con Carl Zimmer en Microbe WORLD
- Publicaciones de Ofria en citas de Google Académico