La banda se formó bajo el nombre de Eternal Grief en 1995. Cambiaron su nombre en 2001 a Cipher System .
La banda lanzó su primer álbum Central Tunnel Eight de Lifeforce Records el 2 de noviembre de 2004. Después de algunos años de silencio, la banda pasó varios meses entre 2010 y 2011 con eso por su cuenta para grabar un nuevo álbum. El álbum fue mezclado en Studio Fredman y se tituló Communicate the Storms . Poco después de que se terminó el álbum, se anunció que la banda firmó con Nuclear Blast , y el álbum fue lanzado por el sello el 9 de septiembre de 2011.