La ciudad fue fundada con la apertura en 1913 de la estación del mismo nombre en el Ferrocarril del Norte Central . Conocido inicialmente como Estación Perico , el pueblo fue uno de los renombrados por Juan Domingo Perón durante la administración del líder populista de 1946-1955.
El gobernador Horacio Guzmán eligió a Perico como el sitio del futuro Aeropuerto Internacional El Cadillal en 1961, y la instalación fue inaugurada en 1967 (fue rebautizada en honor a Guzmán en 1992).
Durante mucho tiempo un centro de producción y distribución de tabaco , los productores de Perico organizaron la Cooperativa de Tabacaleros de Jujuy en 1969, y poco después se abrió una importante planta de cigarrillos Massalin Particulares .
La ubicación estratégica de la localidad entre la capital provincial, San Salvador de Jujuy , y la ciudad de Salta convirtió a la estación ferroviaria en una de las más transitadas de la región. Sin embargo, la privatización del Ferrocarril General Manuel Belgrano después de 1992 provocó el cierre de la estación.
El Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria mantiene una instalación en Perico. Se estableció una Zona Franca ( zona económica libre ) en Perico, y la planta Nobleza Piccardo de la ciudad se convirtió en el mayor productor y exportador de productos de tabaco Blue Virginia del país.
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