El Índice de referencia colocalización Fuente ( CBS ) es una colección gratuita de imágenes descargables para probar y validar el grado de colocalización de los marcadores en cualquier microscopía de fluorescencia estudios. La colocalización es un fenómeno visual cuando dos moléculas de interés están asociadas con las mismas estructuras en las células y potencialmente comparten características funcionales comunes. [1] [2] [3]
Contenido | |
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Descripción | Fuente gratuita de imágenes de referencia para validar la colocalización en estudios de microscopía de fluorescencia |
Contacto | |
Autores | Vadim Zinchuk , Yong Wu , Olga Grossenbacher-Zinchuk |
Fecha de lanzamiento | 2012 |
Acceso | |
Formato de datos | Formato de archivo de imagen con etiquetas sin pérdida (TIFF) |
Sitio web | www |
Diverso | |
Licencia | Libre |
Versión | 1.1.1 |
CBS proporciona a los investigadores herramientas de referencia para verificar los resultados de las mediciones cuantitativas de colocalización. [4] Sirve como una base de datos informática especializada en bioimágenes de imágenes simuladas por computadora con valores de colocalización exactamente conocidos (predefinidos). Fueron creados utilizando un algoritmo de simulación de imágenes . Estas imágenes de referencia se pueden descargar como conjuntos o por separado. Al calcular y comparar los valores de los coeficientes en sus imágenes con las imágenes de referencia, los investigadores pueden validar los resultados de los estudios cuantitativos de colocalización. El uso de imágenes CBS se describió en varios estudios. [5] [6] [7] [8]
Ejemplos de
Los investigadores pueden enviar ejemplos de imágenes personalizadas cuando las imágenes de referencia se utilizaron para validar la colocalización en ellas. Las imágenes enviadas se publican en el sitio de CBS junto con la descripción de sus propiedades y los valores de los coeficientes, como el coeficiente de correlación de Pearson (Rr) , el coeficiente de superposición (R) y otros. La plantilla para enviar información sobre imágenes personalizadas se puede descargar del sitio de CBS.
Ver también
Referencias
- ^ Bolte S y Cordelieres FP (2006). "Una visita guiada al análisis de colocalización subcelular en microscopía óptica". J Microsc 224: 213-232.
- ^ Comeau JW y col. (2006). "Una guía para mediciones precisas de colocalización con microscopía de fluorescencia". Biophys J 91: 4611–4622.
- ^ Zinchuk V y Grossenbacher-Zinchuk O (2009). "Avances recientes en el análisis cuantitativo de colocalización: enfoque en la neurociencia". Prog Histochem Cytochem 44: 125-172.
- ^ Manders E y col. (1993). "Medición de la colocalización de objetos en imágenes confocales de dos colores". J Microsc Oxford 169: 375–382.
- ^ Wu Y y col. (2010). "Determinación cuantitativa de correlaciones espaciales proteína-proteína en microscopía confocal de fluorescencia". Biophys J 98: 493-504.
- ^ Zinchuk V y col. (2011). "Cuantificación de correlaciones espaciales de marcadores fluorescentes utilizando una reducción de fondo mejorada con estimaciones de índice de proximidad de proteínas y coeficientes de correlación". Nat Protocol 6: 1554-1567.
- ^ Zinchuk V y Grossenbacher-Zinchuk O (2011). "Análisis cuantitativo de colocalización de imágenes de microscopía de fluorescencia confocal". Unidad de Biol Celular de Curr Protocols 4.19. Archivado el 28 de noviembre de 2009 en la Wayback Machine.
- ^ Zinchuk V y col. (2013). "Cerrar la brecha entre la colocalización cualitativa y cuantitativa da como resultado estudios de microscopía de fluorescencia". Sci Rep 3: 1365 doi: 10.1038 / srep01365.
enlaces externos
- Página de inicio de Colocalization Benchmark Source