La Copa Sudamericana de Clubes 2006 , oficialmente Copa Nissan Sudamericana de Clubes 2006 por razones de patrocinio, fue una competencia de campeonato internacional de fútbol que fue disputada por 34 equipos en total, incluidos 31 equipos de CONMEBOL y también tres equipos invitados de CONCACAF .
Pachuca ganó su primer título en la historia luego de derrotar a Colo-Colo empatando 1-1 en el partido de ida en México y ganando 2-1 en Chile . Pachuca solo perdió un juego en el torneo, contra el colombiano Deportes Tolima 2-1 en su debut.
Esta fue la segunda vez que un club mexicano llega a la final, luego de que la UNAM perdiera la edición de 2005 ante Boca Juniors . Mientras tanto, esta también fue la primera vez que un club chileno llegó a una final desde la inauguración del torneo en 2002.
Además, esta fue la primera vez que un representante mexicano (o CONCACAF ) ganó la Copa Sudamericana o cualquier torneo sancionado por CONMEBOL .
La tabla da los equipos en la primera ronda reunidos en grupos de eliminación de 2 equipos o 4 equipos. Los equipos que organizan el primer juego están a la izquierda. Los equipos que avanzan están en negrita .
Los Octavos de Final se jugaron entre el 26 de septiembre y el 12 de octubre de 2006. Lo disputaron los diez ganadores de la Primera Ronda, más River Plate, Boca Juniors, Gimnasia y Esgrima, Alajuelense, Toluca y Pachuca. Al igual que en la Primera Vuelta, estos equipos disputaron partidos a doble partido. El equipo #1 jugó primero en casa.