David Sankoff (nacido el 31 de diciembre de 1942) es un matemático, bioinformático, informático y lingüista canadiense. Es titular de la Cátedra de Investigación de Canadá en Genómica Matemática en el Departamento de Matemáticas y Estadística de la Universidad de Ottawa , y es nombrado para el Departamento de Biología y la Escuela de Tecnología e Ingeniería de la Información. Fue editor fundador de la revista científica Language Variation and Change (Cambridge) [6] y forma parte de los consejos editoriales de varias revistas de bioinformática, biología computacional y lingüística. [7] [8] [9] [10] [ cita requerida ]Sankoff es mejor conocido por sus contribuciones pioneras en lingüística computacional y genómica computacional . [3] Se le considera uno de los fundadores de la bioinformática . En particular, tuvo un papel clave en la introducción de la programación dinámica [11] para la alineación de secuencias y otros problemas en biología computacional . En palabras de Pavel Pevzner , [2] "[ Michael Waterman ] y David Sankoff son responsables de transformar la bioinformática de una 'colección de sellos' de problemas mal definidos en una disciplina rigurosa con importantes aplicaciones biológicas".
David Sankoff | |
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Nació | |
Nacionalidad | canadiense |
alma mater | Universidad McGill (BSc, MSc, PhD) |
Conocido por |
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Premios |
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Carrera científica | |
Campos | |
Instituciones | |
Tesis | La lingüística histórica como proceso estocástico (1969) |
Asesor de doctorado | Donald Andrew Dawson [5] |
Sitio web | albuquerque |
Educación
Sankoff publicó su primer artículo en 1963 [12] mientras era un estudiante de licenciatura en Matemáticas en la Universidad McGill . Comenzando con su investigación doctoral, desarrolló formulaciones matemáticas para una serie de conceptos fundamentales en lingüística socio-histórica, incluida la glotocronología , [13] análisis de reglas variables (con Henrietta Cedergren), [14] el mercado lingüístico [15] y el cambio de código. . [dieciséis]
Carrera e investigación
Después de completar su Ph.D. En matemáticas, Sankoff comenzó su carrera académica en la Universidad de Montreal en 1969. En 1971, Sankoff se interesó en la comparación de secuencias moleculares [11] e ideó la primera variante de tiempo cuadrático del algoritmo Needleman-Wunsch para alineación de secuencias por pares . [17] En 1973, Sankoff y Robert Cedergren desarrollaron un método de estimación conjunta para la filogenia y la alineación de secuencia múltiple del ARN ribosómico 5S , [18] sentando las bases algorítmicas de la genómica comparativa . En 1975, Sankoff y Václav Chvátal estudiaron el comportamiento del problema de subsecuencia común más larga en entradas aleatorias; [19] las constantes de proporcionalidad que surgen en este estudio han llegado a conocerse como las constantes de Chvátal-Sankoff . En 1980, Robert Cedergen y David Sankoff crearon el primer grupo de investigación en bioinformática en la Universidad de Montreal . [20] El trabajo de Sankoff en bioinformática aborda la estructura secundaria del ARN , reordenamientos del genoma , alineación de secuencias , evolución del genoma y filogenia . [21]
Premios y honores
- Recibidor inaugural del premio de científico senior de la Sociedad Internacional de Biología Computacional en 2003. [2]
- Elegido miembro de la Royal Society of Canada (1995) [22]
- Elegido miembro de ISCB por la Sociedad Internacional de Biología Computacional en 2009 [1]
- Premio Marcel-Vincent (1977) [23]
- Premio al Investigador Distinguido de Ontario (2002) [22]
- Premio Weldon Memorial (2004) [24]
- Premio a la excelencia en investigación de la Universidad de Ottawa [25] (2013)
- Doctorado honorario, Universidad de Tel Aviv (2014) [26]
Referencias
- ↑ a b Anon (2017). "Becarios ISCB" . iscb.org . Sociedad Internacional de Biología Computacional . Archivado desde el original el 20 de marzo de 2017.
- ^ a b c Maisel, M. (2006). "ISCB honra a Michael S. Waterman y Mathieu Blanchette" . PLOS Biología Computacional . 2 (8): e105. Código Bibliográfico : 2006PLSCB ... 2..105M . doi : 10.1371 / journal.pcbi.0020105 . PMC 1526462 .
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- ^ "Revista de Biología Computacional" . Consultado el 8 de junio de 2019 .
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- ^ Anon (2003). "Premio de científico senior de ISCB a Sankoff" . iscb.org/iscb-awards . Archivado desde el original el 3 de marzo de 2016.
- ^ a b "David Sankoff" . Investigación . Consultado el 3 de noviembre de 2020 .
- ^ "Prix Acfas Thérèse Gouin-Décarie (Prix Marcel-Vincent antes de 2013)" . Acfas PRIX (en francés). 2019 . Consultado el 19 de septiembre de 2020 .
- ^ La profesora Angela McLean recibió la Medalla Weldon . 2018-05-17.
- ^ "David Sankoff - Premio a la excelencia en investigación" . Consultado el 25 de agosto de 2013 .
- ^ "Co-fundador de la bioinformática para recibir un doctorado honoris causa" . Matemáticas . 2019-06-11 . Consultado el 3 de noviembre de 2020 .