La Diócesis Católica Romana de Comayagua es un obispado latino sufragáneo en la provincia eclesiástica (que cubre toda Honduras ) de la Arquidiócesis de Tegucigalpa . La diócesis actual, erigida el 13 de marzo de 1963, revive un obispado colonial más grande.
Su sede catedralicia episcopal actual es la Catedral de la Inmaculada Concepción, dedicada a la Inmaculada Concepción , en Comayagua , ciudad en la que también se encuentra la antigua catedral: Iglesia de La Merced Iglesia de La Merced, dedicada a Nuestra Señora de la Merced .
En 1561, el primer obispado se estableció como Diócesis de Comayagua , en territorio separado de la entonces Diócesis Católica Romana de Trujillo (fundada como diócesis de Honduras), y en 1571 ganó el territorio restante de su obispado madre en su supresión (Trujillo, sin embargo, sería restaurado en 1987).
Como muchas diócesis misioneras, tenía principalmente sacerdotes regulares como Ordinarios, que generalmente morían en el cargo o eran transferidos/promovidos dentro del vasto imperio colonial español.
El 02.02.1916 fue suprimida, dividiéndose su territorio para constituir la Arquidiócesis de Tegucigalpa (su todavía Metropolitana, en la capital nacional), el entonces Vicariato Apostólico de San Pedro Sula y la Diócesis de Santa Rosa de Copán .
Fue restaurada el 13.03.1963, como Diócesis de Comayagua, en un territorio mucho menor (7,527 km 2 ) escindido de su Metropolitana, la Arquidiócesis de Tegucigalpa.