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El Ebbe Nielsen Challenge es una competencia científica internacional que se lleva a cabo anualmente desde 2015 en adelante por el Global Biodiversity Information Facility (GBIF), con un conjunto de premios en efectivo que reconocen las presentaciones de los investigadores en la creación de software o enfoques que abordan con éxito un problema emitido por GBIF. desafío en el campo de la informática de la biodiversidad . Sucede al Premio Ebbe Nielsen , que fue otorgado anualmente por GBIF entre 2002 y 2014. El nombre del desafío honra la memoria de la entomóloga prominente y defensora de la informática de la biodiversidad Ebbe Nielsen , quien murió de un ataque cardíaco en los EE. UU. En el camino hacia el 2001. Reunión de la Junta de Gobierno de GBIF.

Historia

En 2001, GBIF creó el Premio Ebbe Nielsen para honrar al entomólogo danés-australiano recientemente fallecido Ebbe Nielsen , quien fue un entusiasta defensor tanto de GBIF como de la disciplina de la informática de la biodiversidad. [1] Ese premio reconoció a un investigador o equipo de investigación global por su contribución retrospectiva al campo de la informática de la biodiversidad., según los criterios establecidos por GBIF en los términos de la adjudicación. A partir de 2015, GBIF relanzó el proceso de premios como una competencia entre individuos o equipos de investigadores globales para crear nuevos programas o enfoques para usar datos de biodiversidad de acuerdo con un tema anunciado anualmente para cada ronda de la competencia, y también para dividir el premio. dinero entre varios grupos en lugar de un solo ganador como en la era inicial del Premio. [2] Las convocatorias de inscripciones para el concurso, ahora llamado "Ebbe Nielsen Challenge", se han emitido anualmente desde 2015 hasta el presente, y los ganadores se anuncian a través de un proceso competitivo en todos los años, excepto en 2017, cuando se registró un número insuficiente de inscripciones. recibió. [3]

Lista de ganadores, 2015 en adelante

2015

Desafío: "Hacer un uso significativo de los datos mediados por GBIF de una manera que proporcione nuevas representaciones o conocimientos. Su envío podría incluir una variedad de resultados (sitios web, aplicaciones independientes o móviles, o resultados de análisis) o podría tratar de mejorar cualquier número de problemas o procesos, que incluyen (pero no se limitan a) análisis o visualización de datos, flujos de trabajo de datos, carga o anotaciones ". [4]

La lista de finalistas del Desafío 2015 está disponible aquí. [5]

Ganador del primer premio:

  • " Métricas del conjunto de datos de GBIF ": Peter Desmet, Bart Aelterman y Nicolas Noé (Bélgica) [6]

Ganador del segundo premio:

Los detalles están disponibles a través del sitio web de GBIF aquí. [8]

2016

Desafío: "En 2016, el Desafío se centrará en la cuestión de las lagunas y la completitud de los datos, buscando herramientas, métodos y mecanismos para ayudar a analizar la idoneidad para el uso de los datos mediados por GBIF y / o guiar el establecimiento de prioridades para la movilización de datos de biodiversidad. Esperamos que tanto los usuarios como los poseedores de datos se beneficien del énfasis de este año en las lagunas y la integridad ". [9] [10]

Ganador del primer premio:

  • " Explorando la ignorancia en el espacio y el tiempo " - Alejandro Ruete (Argentina) [11]

Ganadores conjuntos del segundo premio:

  • " sampbias ": Alexander Zizka, Alexandre Antonelli y Daniele Silvestro (Suecia) [12]
  • " Herramientas de evaluación de la cobertura de GBIF ": Walter Jetz, Jeremy Malczyk, Carsten Meyer, Michelle Duong, Ajay Ranipeta y Luis J. Villanueva (Estados Unidos, Sudáfrica y Alemania) [13]

Los detalles están disponibles a través del sitio web de GBIF aquí. [14]

2017

Desafío: "El Desafío GBIF Ebbe Nielsen de 2017 busca presentaciones que reutilicen estos conjuntos de datos [en repositorios públicos de acceso abierto] y los adapten al formato Darwin Core Archive (DwC-A), el estándar interoperable y reutilizable que impulsa la publicación de casi 800 millones de registros de ocurrencia de especies de las casi 1,000 instituciones mundiales que ahora están activas en la red de GBIF. El Desafío Ebbe Nielsen 2017 encomendará a los desarrolladores y científicos de datos la creación de aplicaciones web, scripts u otras herramientas que automaticen el descubrimiento y extracción de datos relevantes de biodiversidad a partir de datos abiertos. repositorios ". [15]

No se anunciaron ganadores, lo que indica que el dinero del premio de 2017 no se otorgó a ninguna entrada.

2018

Desafío: "El Desafío Ebbe Nielsen 2018 es deliberadamente abierto, por lo que los participantes tienen un amplio mandato para crear herramientas y técnicas que avancen en la ciencia abierta y mejoren el acceso, la utilidad o la calidad de los datos mediados por GBIF. Las presentaciones del desafío pueden ser nuevas aplicaciones , métodos de visualización, flujos de trabajo o análisis, o se basan en herramientas y funciones existentes y las amplían ". [16] [17]

Ganadores conjuntos del primer premio:

  • " Receta de la lista de verificación: una plantilla para la estandarización reproducible de los datos de la lista de verificación de especies " - Lien Reyserhove, Damiano Oldoni y Peter Desmet (Bélgica) [18]
  • " Ozymandias: un gráfico de conocimiento de la biodiversidad " - Roderic DM Page (Reino Unido) [19]

Ganadores conjuntos del segundo premio:

  • " The bdverse ": Tomer Gueta, Yohay Carmel, Vijay Barve, Thiloshon Nagarajah, Povilas Gibas, Ashwin Agrawal (Israel, Estados Unidos, Sri Lanka, Lituania e India) [20]
  • " GBIF Issues Explorer " - Luis J. Villanueva (Estados Unidos) [21]
  • " Trampa de mosquitos inteligente para la tubería DwC " - Connor Howington y Samuel Rund (Estados Unidos) [22]
  • " Editor del árbol de taxonomía " - Ashish Singh Tomar (España) [23]

Los detalles están disponibles a través del sitio web de GBIF aquí. [24]

2019

Desafío: "El Desafío Ebbe Nielsen 2019 es deliberadamente abierto, por lo que los participantes tienen un amplio mandato para crear herramientas y técnicas que avancen en la ciencia abierta y mejoren el acceso, la utilidad o la calidad de los datos mediados por GBIF. Las presentaciones del desafío pueden ser nuevas aplicaciones , métodos de visualización, flujos de trabajo o análisis, o se basan en y amplían las herramientas y características existentes. Se espera que las entradas exitosas proporcionen soluciones prácticas y pragmáticas para la red de GBIF al tiempo que avanzan la informática de la biodiversidad y la gestión de datos de la biodiversidad en relación con la misión de GBIF y plan." [25]

Ganador del primer premio:

  • " WhereNext: un sistema de recomendaciones para identificar prioridades de muestreo basado en modelos de disimilitud generalizada " - Jorge Velásquez-Tibatá (Colombia) [26]

Ganadores conjuntos del segundo premio:

  • " occCite: Herramientas para permitir una cita completa de datos sobre diversidad biológica " - Hannah L. Owens, Cory Merow, Brian S. Maitner, Vijay V. Barve y Robert Guralnick (Dinamarca, Estados Unidos) [27]
  • " Organella " - Andrea Biedermann, Diana Gert, Dimitar Ruszev y Paul Roeder (Alemania) [28]
  • " Preocupación menor rápida: evaluaciones automatizadas de plantas de menor riesgo para la Lista Roja de Especies Amenazadas de la UICN (Lista Roja) " - Steven Bachman, Barnaby Walker y Justin Moat (Reino Unido) [29]

Ganadores conjuntos del tercer premio:

  • " Publicación ágil de GBIF " - Evgeniy Meyke (Finlandia) [30]
  • " Revisión de la información sobre biodiversidad y apoyo a la toma de decisiones: el paquete BIRDS para R " - Debora Arlt, Alejandro Ruete y Anton Hammarström (Suecia) [31]
  • " GB Sifter: un GBIF para GenBank Data Sifter " - Luis Allende (Estados Unidos) [32]
  • " naturaList " - Arthur Vinicius Rodrigues y Gabriel Nakamura (Brasil) [33]
  • " GeoNature-atlas: Publique un atlas de biodiversidad en línea con datos GBIF de su área " - Jordan Sellies, Amandine Sahl (Francia) [34]

Los detalles están disponibles a través del sitio web de GBIF aquí. [35]

Referencias

  1. ^ Kristensen, Niels P. (2001). "Ebbe Schmidt Nielsen, 7 de junio de 1950 - 6 de marzo de 2001". Nota Lepidopterologica . 24 (3): 3–9.
  2. ^ "Desafío GBIF Ebbe Nielsen" . Desafío GBIF Ebbe Nielsen .
  3. ^ "2018 GBIF Ebbe Nielsen Challenge ahora abierto" . iphylo.blogspot.com .
  4. ^ "Los ganadores nombrados por el primer desafío GBIF Ebbe Nielsen" . www.gbif.org .
  5. ^ "Finalistas para GBIF Ebbe Nielsen Challenge" . dna-barcoding.blogspot.com .
  6. ^ "Métricas del conjunto de datos de GBIF" . chrome.google.com .
  7. ^ "BioGUID.org - datos de enlace cruzado en todo el universo de la biodiversidad mediante el uso de identificadores únicos y objetos de datos relacionados" . devpost.com .
  8. ^ "Desafío GBIF Ebbe Nielsen: dar vida a la información sobre la biodiversidad" . www.gbif.org .
  9. ^ "Desafío GBIF 2016 Ebbe Nielsen: analizar y abordar las lagunas y los sesgos en los datos de biodiversidad primaria" . www.gbif.org .
  10. ^ "Desafío GBIF 2016 Ebbe Nielsen" . www.biodiv.be .
  11. ^ "El científico de SLU ganó un premio por 'Mapeo de ignorancia ' " . www.slu.se .
  12. ^ "sampbias - evaluación de sesgos de muestreo geográfico en conjuntos de datos de distribución de especies" . devpost.com .
  13. ^ "Herramientas de evaluación de cobertura de GBIF: herramientas en línea para identificar y realizar un seguimiento de las lagunas en los datos mediados por GBIF para caracterizar la distribución de especies en el espacio y el tiempo" . devpost.com .
  14. ^ "La entrada de datos 'mapeo de ignorancia' gana 2016 Ebbe Nielsen Challenge" . www.gbif.org .
  15. ^ "Liberar los registros de especies de los repositorios de datos abiertos para el descubrimiento científico y la reutilización" . www.gbif.org .
  16. ^ "2018 GBIF Ebbe Nielsen Challenge busca innovaciones de datos abiertos para la biodiversidad" . www.gbif.org .
  17. ^ "Desafío GBIF Ebbe Nielsen 2018" . www.europeandataportal.eu .
  18. ^ "Receta de la lista de verificación: cómo creamos una plantilla para estandarizar los datos de las especies" . ropensci.org .
  19. ^ "PROF RODERIC PAGE GANA EL PREMIO EBBE NIELSEN" . www.gla.ac.uk .
  20. ^ "bdverse: Marco de limpieza de datos de biodiversidad" . www.researchgate.net .
  21. ^ "La oficina del programa de digitalización de la Smithsonian Institution gana el premio en GBIF 2018 Ebbe Nielsen Challenge" . dpo.si.edu .
  22. ^ "Miembros del equipo VectorBase entre los seis ganadores del desafío Ebbe Nielsen 2018" . www.vectorbase.org .
  23. ^ "POST DE BLOG: exploración visual de datos taxonómicos, filogenómicos y de biodiversidad" . big4-project.eu .
  24. ^ "Seis ganadores encabezan el desafío Ebbe Nielsen 2018" . www.gbif.org .
  25. ^ "2019 GBIF Ebbe Nielsen Challenge busca innovaciones de datos abiertos para la biodiversidad" . www.gbif.org .
  26. ^ "WhereNext: un sistema de recomendación para identificar las prioridades de muestreo basadas en modelos de disimilitud generalizada" . rpubs.com .
  27. ^ "occCite: herramientas para habilitar la cita de datos de biodiversidad integral" . github.com .
  28. ^ "Organella" . netlify.com .
  29. ^ "Preocupación menor rápida: evaluaciones automatizadas de plantas de menor riesgo para la lista roja de especies amenazadas de la UICN (lista roja)" . shinyapps.io .
  30. ^ "Publicación ágil de GBIF" . earthcape.com/ .
  31. ^ "Revisión de información sobre biodiversidad y apoyo a la toma de decisiones: el paquete BIRDS para R" . github.com .
  32. ^ "GB Sifter: un GBIF para GenBank Data Sifter" . youtube.com .
  33. ^ "naturaList" . shinyapps.io .
  34. ^ "GeoNature-atlas: Publique un atlas de biodiversidad en línea con datos GBIF de su área" . ecrins-parcnational.com .
  35. ^ "WhereNext gana 2019 GBIF Ebbe Nielsen Challenge" . www.gbif.org .