Los Premios Eisner se han presentado desde 1988, pero no hubo Premios Eisner en 1990 debido a confusiones en las votaciones. [1] La ceremonia de entrega de premios se lleva a cabo en San Diego Comic-Con desde 1991.
Este premio se conocía anteriormente como "Mejor pintor" de 1993 a 1999 y "Mejor pintor/artista multimedia" de 2000 a 2019.
En 2001, el panel de jueces decidió eliminar la Mejor publicación periódica relacionada con cómics de la boleta electoral; [7] la categoría fue restaurada en 2002.