Waller recopiló unos 20.000 libros importantes sobre ciencia y medicina, incluidos 150 incunables y otras ediciones tempranas. En su última voluntad y testamento dejó toda la colección a la Universidad de Uppsala y su biblioteca . Un catálogo de la colección fue compilado con la mayor competencia y cuidado por Hans Sallander y publicado en dos volúmenes, Uppsala 1955. Incluye unas cincuenta láminas, que reproducen elementos interesantes seleccionados de la colección. La colección de medallas de Waller relacionadas con la historia de la medicina se encuentra en el Gabinete de Monedas de la Universidad de Uppsala .
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