La Unión de Rugby de Estonia ( estonio : Eesti Ragbi Liit ) es el órgano rector de la unión de rugby en Estonia y se formó en 2007 en respuesta a la expulsión de FIRA-AER de la Federación de Rugby de Estonia . En junio de 2009, la Unión de Rugby de Estonia recibió formalmente el reconocimiento como organismo rector de la Unión de Rugby en Estonia por parte del Comité Olímpico de Estonia con permiso para representar a Estonia a nivel internacional.
En 2008, la Unión de Rugby de Estonia firmó un contrato con Advanced Micro Devices como patrocinador principal de Rugby en Estonia y en julio de 2009 AS Tallink , la compañía de ferry más grande de Estonia, acordó apoyar a la Unión. Stash es el proveedor de kits de juego para la Unión de Rugby de Estonia.
Una selección combinada de Estonia y Letonia se enfrentó a una selección sueca a fines de la década de 1990, pero una selección nacional propiamente dicha solo comenzó a jugar en 2009, realizó una gira por Inglaterra y jugó dos partidos, perdiendo ambos.
Se enfrentaron al club Tonbridge Juddians de Kent en su primer partido, saliendo en el lado equivocado de un marcador de 94-7. Los juddianos les dieron un momento bastante tórrido en los scrums, lo que probablemente estuvo influenciado por el hecho de que los estonios solo tuvieron su primera sesión de máquina de scrum en la mañana del partido.
El segundo partido los vio enfrentarse a England Deaf en Folkestone , esta vez logrando mantener el marcador en un respetable 21-27.
El 28 de septiembre de 2013, los estonios ganaron su primer partido oficial contra Finlandia A en Turku, Finlandia. Con una puntuación de 24 a 17.