Schmalzgrueber nació en Griesbach , Baviera . Entrando en la Compañía de Jesús en 1679, hizo sus estudios en Ingolstadt , obteniendo el doctorado tanto en teología como en derecho canónico. Enseñó humanidades en Munich , Dillingen y Neuburg ; filosofía en Mindelheim , Augsburgo e Ingolstadt; teología dogmática en Innsbruck y Lucerna . De 1703 a 1716 (con una interrupción de dos años cuando ocupó la cátedra de teología moral) fue profesor de derecho canónico, alternando entre Dillingen e Ingolstadt. Fue dos veces canciller de la Universidad de Dillingen .; durante dos años censor de libros para los jesuitas en Roma, y durante un período similar prefecto de estudios en Munich. Murió en Dillingen , a los 72 años.
Su obra principal, Jus Ecclesiasticum Universum , publicada por primera vez en Ingolstadt en 1817, pasó por varias ediciones, la última en Roma (1843-5) en doce volúmenes en cuarto . Un compendio de esta obra se denominó Succincta sacrorum canonum doctrina ; otro, Compendium juris ecclesiastici ; ambos se publicaron en Augsburgo en 1747. La obra de Grandclaude (París, 1882-3) es prácticamente un compendio de Schmalzgrueber.
Otros escritos son: Judicium ecclesiasticum , Clerus saecularis et regularis , Sponsalia et matrimonia , Crimen fori ecclesiastici , Consilia seu responsa Juris ; todos aparecieron en Augsburgo entre 1712 y 1722.