La bandera de la región autónoma de facto de Maakhir en Somalia se estableció originalmente con la declaración del primer gobierno de Maakhir, aunque con la emergencia en Maakhir a principios de 2008, el presidente Jibrell Ali Salad pidió un nuevo gobierno para abordar mejor las necesidades de Maakhiris. Luego se propuso una nueva bandera para Maakhir, que es la bandera actual.