La bandera de La Guajira fue adoptada oficialmente por la Asamblea Departamental mediante Ordenanza 028 del 29 de septiembre de 1966. Anteriormente la bandera ya había estado en uso como bandera de la Intendencia de La Guajira, y posteriormente fue modificada últimamente por Ordenanza 052 de 1994.
El Estandarte Gubernamental se basa en la Bandera del Departamento pero se carga en el centro con el Escudo de Armas del Departamento de La Guajira . [1]
El Blanco simboliza la pureza de los indígenas de La Guajira que se caracterizan por ser pacíficos y nobles.
El Blanco también simboliza las riquezas naturales de La Guajira. Aquí, las Salinas de Manaure, una mina de sal en el norte de La Guajira.