Mallery nació en Woodbury, Connecticut . Se graduó de Yale College en 1808. Durante algún tiempo después de graduarse fue director de la Academia en Wilkes Barre, Pensilvania , donde estudió leyes con el Sr. Wells. También asistió a la Facultad de Derecho de Litchfield y fue admitido para ejercer en Wilkes Barre, en 1811.
En 1827 fue elegido miembro de la Legislatura de Pensilvania , sin nominación de partido, y fue reelegido en 1828, 1829 y 1830. Desde su puesto como presidente de los respectivos comités, jugó un papel fundamental en el establecimiento de los sistemas Penitenciario y de Mejoramiento General de Pensilvania. En 1831 fue designado por el Gobernador George Wolf , Juez Presidente del Tercer Distrito Judicial de ese Estado, cargo al que renunció en 1836, y en noviembre del mismo año se trasladó a Filadelfia, para retomar la práctica activa de la abogacía. En esto tuvo un éxito eminente. Durante varios años ocupó el cargo de Maestro en Cancillería de la Corte Suprema de Pensilvania .
El juez Mallery era en el momento de su muerte el miembro en ejercicio de mayor edad del colegio de abogados de Filadelfia. Hasta tal punto conservó su vigor, que sólo seis semanas antes de su muerte llevó a cabo un juicio con jurado muy importante y muy disputado, que duró más de una semana. Recibió en 1840 el grado de LL. D. del Colegio Lafayette .
Murió en Filadelfia, Pensilvania, el 6 de julio de 1866, a la edad de 82 años. Se casó tres veces y dejó cuatro hijos, incluido el etnólogo Garrick Mallery .