Una puerta en citometría es un conjunto de límites de valor (límites) que sirven para aislar un grupo específico de eventos citométricos de un conjunto grande. Las compuertas se pueden definir mediante análisis de discriminación, o simplemente se pueden dibujar alrededor de un conjunto dado de puntos de datos en una copia impresa y luego convertirse a una forma útil para la computadora. Las puertas se pueden implementar con una anteojera física. Las puertas se pueden utilizar para recopilar datos de forma selectiva o para segregar datos para su análisis.
Las puertas se dividen matemáticamente en puertas inclusivas y puertas exclusivas. Las puertas inclusivas seleccionan datos que se encuentran dentro de los límites establecidos, mientras que las puertas exclusivas seleccionan datos que se encuentran fuera de los límites.
Una puerta activa es un término utilizado para un proceso que impide la adquisición por parte de la computadora de datos no seleccionados del citómetro de flujo .