Nació en Litovel , Moravia , y estudió en la Universidad de Viena , donde obtuvo el título de magisterio. Estudió mineralogía en Heidelberg y Tübingen y obtuvo un doctorado . Regresó a Viena como profesor de mineralogía y química y, en 1862, fue nombrado segundo vicecurador del Gabinete Mineralógico Imperial, convirtiéndose en director en 1868. Renunció como director en 1877. También fue profesor de petrografía en la Universidad de Viena. Fue nombrado profesor en 1873 y miembro de la Academia Imperial de Ciencias, miembro de laAmerican Philosophical Society [1] en 1882 y miembro de la Real Academia Sueca de Ciencias en 1905. Murió en 1927, a los 91 años.
Hizo un trabajo útil en muchos minerales y meteoritos . El mineral tschermakite se nombra en su honor. En 1871 estableció el Mineralogische Mitteilungen (Informes mineralógicos), publicado después de 1878 como Mineralogische und petrographische Mitteilungen (Informes minerológicos y petrográficos). Sus publicaciones incluyen:
Tuvo dos hijos, Armin von Tschermak-Seysenegg , profesor de fisiología, y Erich von Tschermak-Seysenegg , botánico, que fueron uno de los redescubridores de las leyes de la genética de Mendel.