Pasó los años 1836-1838 en un seminario de enseñanza en Altdorf , seguido de asignaciones de enseñanza en Leipheim , Neu-Ulm y Augsburgo . Se retiró prematuramente de la docencia en 1861 debido a problemas de la vista. [1]
Con Otto Sendtner (1813–1859), profesor de botánica en la Universidad de Munich , participó en excursiones científicas en las cercanías de Augsburgo y por las montañas de Allgäu . La investigación botánica de Caflisch incluyó estudios sobre los efectos que el clima, la altitud y las condiciones del suelo tenían sobre la distribución geográfica de las plantas . [2]
Fue miembro fundador de la Naturhistorischen Vereins de Augsburgo (Sociedad de Historia Natural de Augsburgo) y hasta su muerte en 1882 estuvo a cargo de las colecciones botánicas del Museo de Ciencias Naturales de Augsburgo. [3]