Estudió botánica y zoología en la Universidad de Jena con Christian Ernst Stahl (1848-1919) y Ernst Haeckel (1834-1919), y continuó sus estudios en la Universidad de Munich con Ludwig Radlkofer (1829-1927) y Richard Hertwig (1850). –1937). Desde 1893 hasta 1897, estuvo basado en el Jardín Botánico Buitenzorg en Java .
En 1894, Hallier se convirtió en el segundo europeo en escalar el monte Kelam (después de cierto Dr. Gürtler) y el primero en recolectar especímenes de la planta jarra Nepenthes clipeata . [1] Ascendió a la cumbre 5 veces en enero y febrero de ese año. [2] Después de su regreso a Alemania, se desempeñó como asistente en el Instituto Botánico de la Universidad de Munich. A partir de 1898, Hallier trabajó en el Museo Botánico de Hamburgo . [3]
Desde 1903-04 participó en una expedición científica a la India , Ceilán y el sudeste asiático marítimo . De 1908 a 1922, Hallier fue curador en el Rijksherbarium de Leiden . [4]
Se le atribuye la introducción de una clasificación filogenética de plantas con flores que se conoció como el "sistema Hallier". [5] [6] Publicó varios trabajos sobre la botánica de las Indias Orientales Holandesas (ahora Indonesia ), incluidos tratados sobre la flora de Borneo .