Durante muchos años estuvo asociado con asuntos políticos locales en el departamento de Colonia . Es miembro del Partido Colorado (Uruguay) y durante la década de 1970 fue un destacado activista del partido.
En 1985, el primo de Jorge Sanguinetti, Julio María Sanguinetti asumió la presidencia de Uruguay , y este último nombró al primero para el cargo de Ministro de Transportes y Obras Públicas. Jorge Sanguinetti ocupó ese cargo hasta 1989.
Posteriormente Sanguinetti se desempeñó como presidente de la empresa petrolera uruguaya ANCAP. Se destacó por su apoyo a la privatización de esa empresa.
En 2007, Sanguinetti se convirtió en partidario de la agrupación Vamos Uruguay de Pedro Bordaberry Herrán dentro del Partido Colorado (Uruguay) . Al hacerlo, se unió a varios otros destacados 'colorados'.