La quinta temporada del drama procesal policial NCIS se estrenó el 25 de septiembre de 2007 y marca el final de la participación de Donald P. Bellisario como show runner . [1] El nuevo showrunner, a partir de esta temporada, es Shane Brennan. Concluye la historia de La Grenouille que terminó con un suspenso en el final de la cuarta temporada, " Ángel de la muerte ". Esta temporada también revela más información de fondo sobre Gibbs .
La producción limitada de episodios de la huelga de Writers Guild y el conjunto de DVD tenía cinco discos en lugar de seis. La temporada terminó con su episodio 19 el 20 de mayo de 2008; la brecha causada por la huelga es entre los episodios 11 y 12. La temporada terminó con un final de temporada en dos partes llamado " Día del Juicio Final ". La temporada contó con la salida de los personajes recurrentes, el coronel Hollis Mann y Jeanne Benoit , así como con la muerte de Jenny Shepard , uno de los personajes principales.
A partir de esta temporada, la secuencia de apertura se acortó a 30 segundos en lugar de los 37 a 44 segundos normales que estaban presentes en las temporadas anteriores.