Lincoln David Stein es científico y profesor de bioinformática y biología computacional en el Instituto de Ontario para la Investigación del Cáncer . [3] [4] [5]
Lincoln Stein | |
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Nació | Lincoln David Stein 1960 (60 a 61 años) [1] |
alma mater | Universidad de Harvard (PhD) |
Premios |
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Carrera científica | |
Campos | Informática del genoma [3] |
Instituciones | |
Tesis | Clonación de genes regulados por el desarrollo de Schistosoma mansoni (1989) |
Sitio web | oicr |
Educación
Stein completó un Doctorado en Medicina en la Escuela de Medicina de Harvard y un Doctorado en Biología Celular en la Universidad de Harvard, ambos en 1989 [6] a través del programa MD-PhD . Su tesis investigó la clonación de genes en Schistosoma mansoni . [6]
Carrera profesional
De 1992 a 1997 fue director de informática en el Centro de Genoma del Instituto de Tecnología de Massachusetts (MIT) , Instituto de Investigación Biomédica de Whitehead . De 1998 a 2004 fue profesor asociado en Cold Spring Harbor Laboratory . Ha estado trabajando en el Instituto de Ontario para la Investigación del Cáncer desde 2007. [ cita requerida ]
Investigar
Los proyectos de investigación actuales de Stein [3] [5] incluyen Reactome , [7] WormBase , [7] BioPerl , [8] Gramene, [9] ENCODE , [10] [11] [12] la base de datos de organismos modelo genérico , [13 ] la ontología de secuencia [14] y la computación en la nube . [15]
Stein también es el desarrollador original de CGI.pm y colaborador de mod_perl , ambos ampliamente utilizados en el lenguaje de programación Perl para aplicaciones web, así como en muchos otros módulos de Perl y libros asociados. [16] [17] [18] [19] [20]
Premios y honores
Stein recibió el premio Benjamin Franklin (Bioinformática) en 2004. [21] Fue elegido miembro de la ISCB en 2016 por la Sociedad Internacional de Biología Computacional . [2]
Referencias
- ^ https://viaf.org/viaf/116663444/
- ↑ a b Anon (2017). "Becarios ISCB" . iscb.org . Sociedad Internacional de Biología Computacional . Archivado desde el original el 20 de marzo de 2017.
- ^ a b c Publicaciones de Lincoln Stein indexadas por Google Scholar
- ^ "El Instituto de Ontario para la Investigación del Cáncer" . Archivado desde el original el 22 de abril de 2011.
- ^ a b Publicaciones de Lincoln Stein indexadas por la base de datos bibliográfica Scopus . (requiere suscripción)
- ^ a b Stein, Lincoln David (1989). Clonación de genes regulados por el desarrollo de Schistosoma mansoni . harvard.edu (tesis doctoral). Universidad Harvard. OCLC 23368773 .
- ^ a b Croft, D .; O'Kelly, G .; Wu, G .; Haw, R .; Gillespie, M .; Matthews, L .; Caudy, M .; Garapati, P .; Gopinath, G .; Jassal, B .; Jupe, S .; Kalatskaya, I .; Mahajan, S .; Mayo, B .; Ndegwa, N .; Schmidt, E .; Shamovsky, V .; Yung, C .; Birney, E .; Hermjakob, H .; d'Eustachio, P .; Stein, L. (2010). "Reactome: una base de datos de reacciones, vías y procesos biológicos" . Investigación de ácidos nucleicos . 39 (Problema de la base de datos): D691 – D697. doi : 10.1093 / nar / gkq1018 . PMC 3013646 . PMID 21067998 .
- ^ Stajich, JE; Block, D .; Boulez, K .; Brenner, S .; Chervitz, S .; Dagdigian, C .; Fuellen, G .; Gilbert, J .; Korf, I .; Lapp, H .; Lehväslaiho, H .; Matsalla, C .; Mungall, CJ; Osborne, BI; Pocock, MR; Schattner, P .; Senger, M .; Stein, LD ; Stupka, E .; Wilkinson, MD; Birney, E. (2002). "El kit de herramientas de BioPerl: módulos de Perl para las ciencias de la vida" . Investigación del genoma . 12 (10): 1611–1618. doi : 10.1101 / gr.361602 . PMC 187536 . PMID 12368254 .
- ^ Ware, DH; Jaiswal, P .; Ni, J .; Yap, IV; Pan, X .; Clark, KY; Teytelman, L .; Schmidt, SC; Zhao, W .; Chang, K .; Cartinhour, S .; Stein, LD; McCouch, SR (2002). "Gramene, una herramienta para la genómica de la hierba" . Fisiología vegetal . 130 (4): 1606–1613. doi : 10.1104 / pp.015248 . PMC 1540266 . PMID 12481044 .
- ^ Gerstein MB , Lu ZJ, Van Nostrand EL, Cheng C, Arshinoff BI, Liu T, Yip KY, Robilotto R, Rechtsteiner A; et al. (2010). "Análisis integrativo del genoma de Caenorhabditis elegans por el proyecto modENCODE" . Ciencia . 330 (6012): 1775-1787. Código Bibliográfico : 2010Sci ... 330.1775G . doi : 10.1126 / science.1196914 . PMC 3142569 . PMID 21177976 .CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
- ^ Consorcio modENCODE, Roy S, Ernst J, Kharchenko PV, Kheradpour P, Negre N, Eaton ML, Landolin JM, Bristow CA, Ma L; et al. (2010). "Identificación de elementos funcionales y circuitos reguladores por Drosophila modENCODE" . Ciencia . 330 (6012): 1787-1797. Código Bibliográfico : 2010Sci ... 330.1787R . doi : 10.1126 / science.1198374 . PMC 3192495 . PMID 21177974 .CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
- ^ Contrino, S .; Smith, RN; Butano, D .; Carr, A .; Hu, F .; Lyne, R .; Rutherford, K .; Kalderimis, A .; Sullivan, J .; Carbono, S .; Kephart, ET; Lloyd, P .; Stinson, EO; Washington, NL; Perry, MD; Ruzanov, P .; Zha, Z .; Lewis, SE; Stein, LD; Micklem, G. (2011). "ModMine: Acceso flexible a datos modENCODE" . Investigación de ácidos nucleicos . 40 (Problema de la base de datos): D1082 – D1088. doi : 10.1093 / nar / gkr921 . PMC 3245176 . PMID 22080565 .
- ^ Stein, LD ; Mungall, C .; Shu, S .; Caudy, M .; Mangone, M .; Día, A .; Nickerson, E .; Stajich, JE; Harris, TW; Arva, A .; Lewis, S. (2002). "El navegador del genoma genérico: un bloque de construcción para una base de datos de sistema de organismo modelo" . Investigación del genoma . 12 (10): 1599-1610. doi : 10.1101 / gr.403602 . PMC 187535 . PMID 12368253 .
- ^ Eilbeck, K .; Lewis, SE ; Mungall, CJ; Yandell, M .; Stein, L .; Durbin, R .; Ashburner, M. (2005). "La secuencia de la ontología: una herramienta para la unificación de anotaciones del genoma" . Biología del genoma . 6 (5): R44. doi : 10.1186 / gb-2005-6-5-r44 . PMC 1175956 . PMID 15892872 .
- ^ Stein, LD (2010). "El caso de la computación en nube en la informática del genoma" . Biología del genoma . 11 (5): 207. doi : 10.1186 / gb-2010-11-5-207 . PMC 2898083 . PMID 20441614 .
- ^ Stein, Lincoln D. (1998). Guía oficial de programación con CGI. pm: [el estándar para crear scripts web] . Nueva York: Wiley. ISBN 978-0-471-24744-9.
- ^ Doug MacEachern; Stein, Lincoln D. (1999). De módulos Apache con Perl y C . Sebastopol, CA: O'Reilly. ISBN 978-1-56592-567-0.
- ^ Stein, Lincoln D. (2001). Programación en red con Perl . Boston: Addison-Wesley. ISBN 978-0-201-61571-5.
- ^ Stein, Lincoln D. (1997). Cómo configurar y mantener un sitio web . Boston: Addison-Wesley. ISBN 978-0-201-63462-4.
- ^ Stein, Lincoln D. (1998). Seguridad web: una guía de referencia paso a paso . Boston: Addison-Wesley. ISBN 978-0-201-63489-1.
- ^ http://www.bioinformatics.org/franklin/2004/ 2004 Premio Benjamin Franklin otorgado a Lincoln D. Stein