MDGRAPE-3 es un sistema de supercomputadora de petaescala de ultra alto rendimiento desarrollado por el instituto de investigación Riken en Japón . Es un sistema de propósito especial construido para simulaciones de dinámica molecular , especialmente la predicción de estructura de proteínas . [1]
MDGRAPE-3 consta de 201 unidades de 24 chips MDGRAPE-3 personalizados (4.824 en total), más procesadores Intel Xeon de doble núcleo adicionales (nombre en clave "Dempsey" ) que sirven como máquinas anfitrionas.
En junio de 2006, Riken anunció su finalización, [2] logrando el nivel petaFLOPS de rendimiento aritmético de coma flotante. [2] Esto fue más de tres veces más rápido que la versión 2006 del sistema IBM Blue Gene / L , que luego encabezó la lista TOP500 de supercomputadoras con 0.28 petaFLOPS. Debido a que no es una máquina de uso general capaz de ejecutar los puntos de referencia de LINPACK , MDGRAPE-3 no califica para la lista TOP500.