La Meistriliiga 1995–96 fue la quinta temporada de la Meistriliiga , la principal liga de fútbol de Estonia. Lantana ganó su primer título.
Eesti Põlevkivi Jõhvi y PJK Kalev, los equipos que terminaron en las dos últimas posiciones en la ronda preliminar, se enfrentaron a los cuatro mejores equipos de la Esiliiga 1995-96 en el desempate por dos puestos en la Meistriliiga 1996-97 .