Michael Waterman

Matemático estadounidense

Michael Waterman
Michael Waterman en 2004
Nació	Michael Spencer Waterman 28 de junio de 1942 (edad  (1942-06-28)79) [1] Coquille, Oregón , Estados Unidos
alma mater	Universidad Estatal de Oregon Universidad Estatal de Michigan (PhD)
Conocido por	Algoritmo de Smith-Waterman Fórmula de Lander-Waterman Ensamblaje de secuencia de De Bruijn
Premios	Beca Guggenheim (1995) [2] Premio Internacional de la Fundación Gairdner (2002) [2] Becario ISCB (2009) [3] Premio Dan David (2015) [4]
Carrera científica
Los campos	Biología Computacional Probabilidad Estadísticas Ciencias de la Computación Matemáticas discretas Combinatoria
Instituciones	Universidad de Virginia Universidad del Sur de California Laboratorio Nacional Los Alamos Universidad Estatal de Idaho
Tesis	Algunas propiedades ergódicas de las expansiones en F multidimensionales  (1969)
Asesor de doctorado	John Rankin Kinney [5]
Estudiantes notables	Pavel Pevzner (postdoctorado)
Influencias	Temple F. Smith
Sitio web	dornsife .usc .edu / labs / msw /

Michael Spencer Waterman (nacido el 28 de junio de 1942) es profesor de Biología , Matemáticas e Informática en la Universidad del Sur de California (USC) , ^{[2] [6]} donde ocupa una cátedra de Asociados en Ciencias Biológicas, Matemáticas e Informática. Ciencias. Él anteriormente ^{[ ¿cuándo? ]} ocupó cargos en el Laboratorio Nacional de Los Alamos y en la Universidad Estatal de Idaho .

Educación y vida temprana

Waterman creció cerca de Bandon, Oregon , ^[7] y obtuvo una licenciatura en Matemáticas de la Universidad Estatal de Oregon , seguida de un doctorado en estadística y probabilidad de la Universidad Estatal de Michigan en 1969. ^{[5] [8]}

Investigación y carrera

Waterman es uno de los fundadores y líderes actuales en el área de la biología computacional . Se enfoca en aplicar técnicas de matemáticas, estadística e informática a varios problemas de biología molecular . Su trabajo ha contribuido a algunas de las herramientas más utilizadas en el campo. En particular, el algoritmo de Smith-Waterman (desarrollado con Temple F. Smith ) es la base de muchos programas de alineación de secuencias . ^[9] En 1988, Waterman y Eric Lander publicaron un artículo histórico que describe un modelo matemático para el mapeo de huellas dactilares. ^[10]Este trabajo formó una de las piedras angulares teóricas de muchos de los proyectos posteriores de mapeo y secuenciación del ADN, especialmente el Proyecto Genoma Humano . Un artículo de 1995 de Idury y Waterman presentó el ensamblaje de secuencias Eulerian- De Bruijn, que se usa ampliamente en proyectos de secuenciación de próxima generación. ^[11]

Con Pavel A. Pevzner , (un ex investigador postdoctoral en su laboratorio) comenzó la conferencia internacional Research in Computational Molecular Biology (RECOMB) , ^[12] y es editor fundador del Journal of Computational Biology . Waterman también es autor de uno de los primeros libros de texto en el campo: Introducción a la biología computacional . ^[13]

Premios y honores

Con Cyrus Chothia y David Haussler , Waterman recibió el premio Dan David 2015 por sus contribuciones al campo de la bioinformática . ^[4] Se le otorgó un Doctorado Honoris Causa de la Universidad de Tel Aviv en 2011, ^{[ cita requerida ]} y un Doctorado Honoris Causa de la Universidad del Sur de Dinamarca en 2013. ^{[ cita requerida ]}

Waterman ha sido miembro de la Academia Estadounidense de Artes y Ciencias de EE. UU. Desde 1995, ^{[ cita requerida ]} miembro de la Academia Nacional de Ingeniería de EE. UU. Desde 2012, ^{[ cita requerida ]} miembro de la Academia China de Ciencias desde 2013, ^{[ cita necesario ]} y miembro de la Academia Nacional de Ciencias de EE. UU. desde 2001. ^{[ cita requerida ]} Ha sido académico de la Academia Francesa de Ciencias desde 2005. ^{[ cita requerida ]}

Waterman fue elegido miembro de la ISCB en 2009 por la Sociedad Internacional de Biología Computacional ^[3] y recibió el premio ISCB Senior Scientist Award en 2009. ^[6]

Vida personal

Waterman ha escrito un libro de memorias, Getting Outside , ^[7] sobre una infancia que pasó en un rancho de ganado aislado en la costa sur de Oregón a mediados del siglo XX.

Referencias

1. Hombres y mujeres estadounidenses de la ciencia, Thomson Gale 2005 ^{[ falta el ISBN ]}
2. Anon (2017). "Michael S. Waterman: profesor de ciencias biológicas, matemáticas, informática, Universidad del Sur de California" . dornsife.usc.edu/labs/msw . Archivado desde el original el 2 de febrero de 2017.
3. Anon (2017). "Becarios ISCB" . iscb.org . Sociedad Internacional de Biología Computacional . Archivado desde el original el 20 de marzo de 2017.
4. Anon (2015). "Jimmy Wales cofundador de Wikipedia entre los ganadores del premio Dan David 2015" . eurekalert.org . Consultado el 13 de febrero de 2015 .
5. Michael Waterman en el Proyecto de genealogía de matemáticas
6. Maisel, M. (2006). "ISCB honra a Michael S. Waterman y Mathieu Blanchette" . PLOS Biología Computacional . 2 (8): e105. Código Bibliográfico : 2006PLSCB ... 2..105M . doi : 10.1371 / journal.pcbi.0020105 . PMC 1526462 . 
7. Waterman, Michael (2016). Salir: una infancia del lejano oeste . Plataforma de publicación independiente CreateSpace. ISBN 978-1530929344.
8. Waterman, Michael Smith (1969). Algunas propiedades ergódicas de las expansiones en F multidimensionales (tesis doctoral). Universidad del estado de michigan. OCLC 25799203 . ProQuest 302449931 .   (requiere suscripción)
9. Smith, T .; Waterman, MS (1981). "Identificación de subsecuencias moleculares comunes". Revista de Biología Molecular . 147 (1): 195-197. CiteSeerX 10.1.1.63.2897 . doi : 10.1016 / 0022-2836 (81) 90087-5 . PMID 7265238 .  
10. Lander, ES ; Waterman, MS (1988). "Mapeo genómico por huellas dactilares de clones aleatorios: un análisis matemático". Genómica . 2 (3): 231–239. doi : 10.1016 / 0888-7543 (88) 90007-9 . PMID 3294162 . 
11. Idury, Ramana M .; Waterman, Michael S. (1995). "Un nuevo algoritmo para el ensamblaje de secuencias de ADN" (PDF) . Revista de Biología Computacional . 2 (2): 291-306. CiteSeerX 10.1.1.79.6459 . doi : 10.1089 / cmb.1995.2.291 . ISSN 1066-5277 . PMID 7497130 .    
12. Anon (2017). "La serie de conferencias RECOMB" . recomb.org .
13. Waterman, Michael R .; Waterman, MS (1995). Introducción a la biología computacional: mapas, secuencias y genomas . Londres: Chapman & Hall. ISBN 978-0-412-99391-6.