La microelectroforesis es un método para estudiar la electroforesis de varias partículas dispersas mediante microscopía óptica . Este método proporciona imágenes de partículas en movimiento, que es su ventaja única. por ejemplo, observación de glóbulos rojos, neutrófilos y bacterias. Este tipo de electroforesis se realiza en un medio cerrado con observaciones críticas enfocando y ajustando la lente del microscopio.
La segunda complejidad proviene de la necesidad de diluir la muestra, si inicialmente estaba concentrada. La concentración debe ser lo suficientemente baja para observar partículas individuales.
La medición en los fluidos de baja polaridad presenta problemas adicionales. Estos sistemas tienen baja conductividad eléctrica y baja permitividad dieléctrica . La movilidad electroforética es baja y esto requiere un campo eléctrico alto, por factor 10 o más.