El Miyako es una de las ocho razas consideradas nativas de Japón. La isla Miyako, en la prefectura de Okinawa , ha sido conocida como zona de cría de caballos durante siglos, y siempre se han encontrado caballos pequeños en esta zona. Durante y después de la Segunda Guerra Mundial, se cruzaron con sementales más grandes para aumentar su tamaño a unas 14 manos con fines agrícolas. Se utilizan principalmente como caballos de montar y para trabajos de tiro ligero.
Alrededor de 1955, la población de la raza alcanzó un máximo de alrededor de 10.000 cabezas, pero con el aumento de la motorización comenzaron a disminuir. Desde 1975 se han hecho grandes esfuerzos para preservar los pocos caballos Miyako que quedan, ya que la raza es muy antigua. En 1983 sólo vivían siete cabezas, la población creció a 25 caballos en 1993, pero había disminuido a 19 en 2001. La raza está protegida por el gobierno japonés y su estado figura como "de mantenimiento crítico". [1]