Mystacina es el único género superviviente de la familia Mystacinidae . El murciélago de cola corta menor de Nueva Zelanda es el único miembro de este grupo que sobrevive hoy, aunque el murciélago de cola corta mayor de Nueva Zelanda estrechamente relacionadose extinguió en 1965. [1] Una tercera especie, Mystacina miocenalis , se conoce de el Mioceno Medio hace unos 19-16 millones de años. [2] [3]