Nagayo se encuentra en la parte sur de la prefectura de Nagasaki y reside en el sur de la bahía de Ōmura .
En el período Edo de finales del siglo XVIII, la cerámica Nagayo se estableció y se produjo hasta finales del siglo XIX.
Al 1 de marzo de 2017, la ciudad tiene una población estimada de 42.570 y una densidad de 1.500 personas por km². La superficie total es de 28,81 km².