Narutō Town se estableció el 1 de abril de 1889 dentro del distrito de Musha . El distrito de Musha pasó a formar parte del distrito de Sanbu a partir del 1 de abril de 1897. El 1 de octubre de 1954 Narutō se expandió mediante la anexión de los pueblos vecinos de Ōtomi y Nangō, y el pueblo de Midorimi el 1 de julio de 1955.
El 27 de marzo de 2006, Narutō, junto con las ciudades de Matsuo y Sanbu , y el pueblo de Hasunuma (todos del distrito de Sanbu ), se fusionaron para crear la ciudad de Sanmu y, por lo tanto, ya no existe como municipio independiente.
A partir del 1 de noviembre de 2005 (último dato del censo antes de la fusión), la ciudad tenía una población estimada de 24.677 y una densidad de población de 525 personas por km². La superficie total era de 47,02 km².