Fue fundada como Facultad de Medicina del Instituto de Medicina Veterinaria y Zoología de Siberia en 1920 y reorganizada como Instituto Médico Estatal de Siberia Occidental en 1921.
Pasó a llamarse Instituto Médico Estatal de Omsk en 1925 y Academia Médica Estatal de Omsk en 1994.
Hay más de 40.000 graduados de OSMU en Rusia y en el extranjero, y hay más de 5.500 estudiantes estudiando en cinco facultades : medicina, pediatría , medicina preventiva , estomatología y farmacéutica .. La facultad de medicina (la más antigua de la escuela) se fundó en 1920. La facultad de maternidad y protección infantil se estableció en 1931 y se reorganizó en la facultad de pediatría en 1934. La facultad de sanidad e higiene se fundó en 1938 y pasó a llamarse medicina preventiva. en 1989. La facultad de odontología se estableció en 1957 y la facultad de farmacia se fundó en 2002. Desde 1997, la OSMU ha estado dirigida por Alexander I. Novikov, MD, PhD, profesor y académico de la Academia Internacional de Ciencias Avanzadas.
Los científicos asociados con OSMU incluyen a Raymond Achrem-Achremovich , Valentine Bisyarina , Peter Gorizontov , Vladimir Eliseev, Vladimir Pulkis , Leonid Maslov, Constantine Romodanovsky y Olga Sokolova-Ponomareva . El personal de OSMU incluye miembros de los Trabajadores Científicos Honoríficos de la Federación Rusa, Trabajadores Honorarios del Personal de la Escuela Superior de la Federación Rusa, Médicos Honoríficos de la Federación Rusa y profesores honorarios.
OSMU tiene relaciones con instituciones educativas en Europa Occidental, Estados Unidos, Japón y otros países. La escuela consta de 59 departamentos. De su personal, el 73 por ciento tiene un título académico y la academia emplea a más de 100 profesores titulares MD- PhD y 300 profesores asociados MD-PhD.
El campus incluye seis edificios, con tres dormitorios que brindan alojamiento a estudiantes de fuera de la ciudad. El proceso educativo utiliza tecnología de la información actualizada. La academia cuenta con una red educativa electrónica integrada con internet, con 350 terminales de cómputo y 12 clases de computación.