Otto III ( c. 1218 - 19 de junio de 1248), miembro de la Casa de Andechs , fue el conde de Borgoña desde 1231 y el último duque de Merania (numerado Otto II ) desde 1234 hasta su muerte.
Otto era el único hijo del duque Otto I de Merania y la condesa Beatriz II de Borgoña . Sucedió a su madre como conde de Borgoña a su muerte en 1231, ya su padre como duque de Andechs y Merania a su muerte en 1234. Ese mismo año se casó con Isabel, hija del conde Alberto IV de Tirol . El matrimonio no tuvo hijos.
Todavía menor de edad, Otto permaneció bajo la tutela de su pariente Andechs, el obispo Ekbert de Bamberg hasta 1236. Cuando alcanzó la mayoría de edad, dejó la administración del condado de Borgoña ( Franco Condado ) al rey Teobaldo I de Navarra para dedicarse a la lucha en torno a sus posesiones bávaras contra la Casa ducal de Wittelsbach . Perdió su posición como vogt de la abadía de Tegernsee, así como la sede ancestral en Andechs , pero retuvo la posesión de Innsbruck , que elevó a ciudad .en 1239 y puesta bajo la administración de su suegro el conde Alberto IV de Tirol. En 1242 entregó Franco Condado en prenda al duque Hugo IV de Borgoña .
En sus últimos años, Otto se concentró en las propiedades de su familia en Franconia . En la feroz controversia entre el emperador Federico II y el papa Inocencio IV , se puso del lado de su señor feudal, el obispo de Bamberg, lo que le valió una proscripción imperial y una pérdida a gran escala de sus posesiones. Al igual que sus antepasados Andechs, benefició a la abadía cisterciense en Langheim , Franconia , donde fue enterrado tras su muerte en 1248. También otorgó derechos de ciudad a la vecina Lichtenfels en 1231. Sin hijos, fue sucedido en Borgoña por su hermana Adelaide y su esposo el conde Hugo de Chalon, mientras expiró el Ducado de Merania. Con la muerte del patriarca Berthold de Aquileia , tío de Otto, en 1251, la Casa de Andechs se extinguió.