Pietro procedía de la aristocrática familia romana de Colonna . Era hermano de Sciarra Colonna y Stephen el Mayor y sobrino del cardenal Giovanni Colonna . Gracias a la protección de su tío, fue nombrado miembro del Colegio Cardenalicio el 16 de mayo de 1288, recibiendo del entonces Papa Nicolás IV el título de cardenal-diácono S. Eustachio. Señaló las bulas papales entre el 3 de septiembre de 1288 y el 21 de junio de 1295. Colonna recibió a varios beneficiarios en la diócesis de Roma, entre otras iglesias. Participó en la elección papal de 1292-1294 y el cónclave de 1294 .
En 1297 estalló un conflicto entre el Papa Bonifacio VIII y la familia Colonna, que estaba aliada con el rey francés Felipe el Hermoso . Bonifacio VIII exigió entonces a los Colonne la emisión de sus fortalezas, y ante su negativa, el 10 de mayo de 1297 excomulgó a los líderes de la familia y depuso a los dos representantes de Colonna en el Colegio Cardenalicio, Pietro y su tío Giacomo. En respuesta, anunciaron un manifiesto que culpaba a Bonifacio VIII por la muerte de su predecesor el Papa Celestino V y la ilegalidad de su elección. El Papa llamó entonces a la cruzada, que terminó con la destrucción de Palestrina, uno de los centros familiares.
Tras la muerte de Bonifacio, VIII Pietro y Giacomo fueron excluidos de participar en la elección de sucesor debido a las excomuniones que les fueron impuestas. El entonces elegido Papa Benedicto XI retiró las sanciones impuestas por la iglesia, pero para una rehabilitación completa tuvieron que esperar hasta la elección del Papa Clemente V en 1305. El 15 de diciembre de 1305, Pietro fue reelegido cardenal-diácono, aunque sin un iglesia titular asignada. También asumió la función de arcipreste de la Basílica de Letrán. Señaló la bula de Clemente V del 20 de julio de 1307. Colonna participó en el cónclave 1314-1316 . El entonces elegido Papa Juan XXIIle concedió la iglesia titular de S. Angelo en Pescheria (2 de marzo de 1317) y lo nombró arcipreste de la Basílica de S. Maria Maggiore el 16 de agosto de 1318.