El Palacio Presidencial de Honduras es la residencia oficial del Presidente de la República de Honduras . Actualmente el presidente reside en el Palacio José Cecilio del Valle .
En 1821 el 'Ayuntamiento de Comayagua' fue la primera residencia oficial del jefe de Estado hondureño. La ubicación de la capital permaneció allí por casi 60 años, hasta que fue trasladada a Tegucigalpa , mediante Decreto No. 11 el 30 de octubre de 1880. El doctor Marco Aurelio Soto , el “Reformador de la República”, también reubicó la sede judicial y legislativa. la reserva federal, y la universidad estatal hasta Tegucigalpa.
La primera casa presidencial en la ciudad de Tegucigalpa fue un edificio de madera de dos pisos construido por Juan Judas Salavarría, ubicado en el costado suroeste de la Plaza de la Merced. Hoy es la planta baja del actual Palacio Legislativo. Las oficinas ejecutivas se ubicaron en el segundo piso, donde se encontraban las oficinas del señor presidente Dr. Soto y del secretario general de gobierno Dr. Ramón Rosa .
En 1883 el presidente de Honduras, el general Luis Bográn , decidió que la concurrida casa de la Plaza de la Merced no era lo suficientemente adecuada, y trasladó las oficinas a otro edificio, que estaba a la derecha de la sala de sesiones del Congreso Nacional. Este edificio tenía cimientos de piedra, muros de adobe y amplios salones para la administración gubernamental, decorados con el estandarte nacional, pabellón, escudos y pinturas de los héroes nacionales. También tenía una parte destinada a la guardia o escolta presidencial, que luego se convertiría en la Escuela de Cabos y Sargentos.
En esta casa vivieron los siguientes presidentes hondureños: General Luis Bográn Barahona , General Ponciano Leiva Madrid , General Domingo Vásquez Toruño , Doctor Policarpo Bonilla Vásquez , Ingeniero Terencio Sierra Romero , General Manuel Bonilla Chirinos , Doctor Miguel Rafael Dávila Cuéllar y Doctor Francisco Bertrand Barahona . El doctor Francisco Bertrand Barahona volvería a trasladar la sede gubernamental a un nuevo edificio donde hoy se encuentra el Banco Central de Honduras, y donde solía estar la Oficina Nacional de Correos.