RMBase (Base de modificación de ARN)


RMBase (Base de modificación de ARN) [1] [2] está diseñado para decodificar el panorama de modificaciones de ARN identificadas a partir de datos de secuenciación de alto rendimiento (MeRIP-seq, m6A-seq, miCLIP, m6A-CLIP, Pseudo-seq, Ψ-seq , CeU-seq, Aza-IP, RiboMeth-seq). Contiene ~124200 N6-metiladenosinas (m6A), ~9500 modificaciones de pseudouridina (Ψ), ~1000 modificaciones de 5-metilcitosina (m5C), ~1210 2′-O-metilaciones (2′-O-Me) y ~3130 otros tipos de modificaciones de ARN. RMBase demostró miles de modificaciones de ARN ubicadas dentro de mRNA, ncRNA reguladores (por ejemplo, lncRNA, miRNA, pseudogenes, circRNA, snoRNA, tRNA), sitios objetivo de miRNA y SNP relacionados con enfermedades.