Rafael Hoyos Rubio (1924-1981) fue un general peruano que ocupó el grado de General del Ejército y ocupó el cargo de Comandante en Jefe del Ejército del Perú desde el 5 de diciembre de 1980 hasta junio de 1981. Nació en Cajamarca el 8 de enero. , 1924 y murió en la frontera entre Perú y Ecuador en 1981.
Orestes era hijo de Hoyos Rocha y Victoria Rubio Villacorta. Estaba casado con Nelly De Vinatea, quien le dio seis hijos, entre ellos Rafael (quien también llegó a ser General del Ejército), María Victoria, Raúl, Luis, Nelly y Carmen.
Rubio completó su educación primaria y secundaria en la ciudad de Cajamarca . En 1942 ingresó en el Ejército como soldado voluntario y pasó a estudiar en la Escuela de Clases. En marzo de 1944 ingresa en la Escuela Militar de Chorrillos , egresándose de Subteniente de Infantería con la Promoción 50 "Junín".
En 1955 ingresó en el War College. Posteriormente realizó cursos de entrenamiento avanzado táctico en Fort Gulick Panamá e Infantería Avanzada en Fort Benning , EE. UU.
A lo largo de su carrera Rubio se desempeñó en diversas guarniciones de la República, además fue instructor en la Escuela Militar de Chorrillos y en la Escuela de Infantería. Entre 1966 y 1968 se desempeñó como agregado militar en Chile. Como General de Brigada fue Jefe del Destacamento de Fuerzas Especiales y Comandante de la Novena División Blindada. Durante el gobierno del general Juan Velasco Alvarado se desempeñó como ministro de Alimentación. En 1978 ya ostentaba el grado de General de División, se desempeñó como Comandante General de los Centros Académicos y Mayor General del Ejército del Estado en 1979. Fue presidente del Comando Conjunto de las Fuerzas Armadas (1979-1980).
En 1981 fue Comandante General del Ejército y como tal estuvo a cargo de las operaciones de la Cordillera del Cóndor , actuando en el punto Paquisha en el enfrentamiento con Ecuador .