Rafael Irizarry es profesor de bioestadística en la Escuela de Salud Pública TH Chan de Harvard y profesor de bioestadística y biología computacional en el Instituto de Cáncer Dana-Farber . [1] [2] [3] Irizarry es conocido como uno de los fundadores del proyecto Bioconductor .
Rafael Angel Irizarry | |
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Educación | Universidad de California, Berkeley |
Conocido por | Bioconductor |
Premios | |
Carrera científica | |
Tesis | Estadística y música: adaptación de un modelo armónico local a las señales sonoras musicales (1998) |
Asesor de doctorado | David Brillinger |
Educación
Irizarry obtuvo su Licenciatura en Matemáticas de la Universidad de Puerto Rico en Río Piedras en 1993, seguida de una Maestría en Artes de la Universidad de California, Berkeley en 1994. Continuó sus estudios en Berkeley, obteniendo un Doctorado en Estadística en 1998. Su tesis doctoral exploró el uso de estadísticas para modelar armonías en señales de sonido. [4] [5]
Investigar
Irizarry se unió a la Escuela de Salud Pública Johns Hopkins Bloomberg en 1998, donde su investigación se centró en la genómica y la biología computacional . [4] Ha trabajado en el análisis y procesamiento de datos que surgen de experimentos de microarrays y ayudó a desarrollar el método Robust Multiarray Analysis (RMA) para el análisis de microarrays en colaboración con el estadístico Terry Speed y sus colegas; [6] Este método se amplió posteriormente como el método RMA congelado (fRMA). [7] [8] También ha trabajado en el análisis de datos de secuenciación de próxima generación .
Irizarry es uno de los fundadores de la Bioconductor proyecto, un proyecto de software de código abierto y el desarrollo para el análisis de datos genómicos en el lenguaje de programación R . [9] [10] [11] Ha participado en el desarrollo de varios de los paquetes de bioconductores más utilizados, incluido el paquete 'affy' para el análisis de datos de microarrays de Affymetrix . [8] [12] [13]
Irizarry es el desarrollador e instructor del curso en línea Análisis de datos para ciencias biológicas en la plataforma edX de la Universidad de Harvard ; este curso inscribe a más de 30.000 estudiantes por año. [8] [14]
Premios
Premio de los Presidentes de COPSS 2009 en estadística. [15]
Premio Mortimer Spiegelman 2009 de la Asociación Estadounidense de Salud Pública [16] [17] otorgado a destacados estadísticos de salud pública menores de 40 años.
Premio Benjamin Franklin 2017 en Bioinformática por su promoción de materiales y métodos gratuitos y de acceso abierto en las ciencias de la vida. [18] [19]
Fue elegido miembro de la Sociedad Internacional de Biología Computacional en 2020. [20]
Referencias
- ^ "Rafael Irizarry" . Departamento de Física de la Universidad de Harvard . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
- ^ "Rafael Irizarry, PhD - DF / HCC" . Dana – Farber / Harvard Cancer Center . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
- ^ Zimmer, Carl (1 de julio de 2016). "Dolores de crecimiento para el campo de la epigenética como algunos piden una revisión" . The New York Times . Consultado el 30 de agosto de 2017 .
- ^ a b Irizarry, Rafael. "Acerca de" . Laboratorio Rafael Irizarry .
- ^ Irizarry, Rafael (1998). "Estadística y música: ajuste de un modelo armónico local a las señales sonoras musicales (tesis doctoral)" (PDF) . S2CID 58781935 . Archivado desde el original (PDF) el 12 de agosto de 2017 . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
- ^ Pevsner, Jonathan (2015). Bioinformática y genómica funcional (3ª ed.). John Wiley e hijos. pag. 488. ISBN 978-1-118-58178-0. Consultado el 30 de agosto de 2017 .
- ^ McCall, MN; Bolstad, BM; Irizarry, RA (22 de enero de 2010). "Análisis multiarray robusto congelado (fRMA)" . Bioestadística . 11 (2): 242-253. doi : 10.1093 / bioestadística / kxp059 . PMC 2830579 . PMID 20097884 .
- ^ a b c "Anuncio del laureado con el premio Benjamin Franklin 2017" . Bioinformatics.org . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
- ^ "Rafael Irizarry" . edX . 20 de diciembre de 2013 . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
- ^ Caballero, Robert C; Carey, Vincent J; Bates, Douglas M; Bolstad, Ben; Dettling, Marcel; Dudoit, Sandrine ; Ellis, Byron; Gautier, Laurent; Ge, Yongchao; Gentry, Jeff; Hornik, Kurt; Hothorn, Torsten; Huber, Wolfgang; Iacus, Stefano; Irizarry, Rafael; Leisch, Friedrich; Li, Cheng; Maechler, Martin; Rossini, Anthony J; Sawitzki, Gunther; Smith, Colin; Smyth, Gordon; Tierney, Luke; Yang, Jean YH; Zhang, Jianhua (2004). "Bioconductor: desarrollo de software abierto para biología computacional y bioinformática" . Biología del genoma . 5 (10): R80. doi : 10.1186 / gb-2004-5-10-r80 . PMC 545600 . PMID 15461798 .
- ^ Mulekar, Madhuri. "Estadísticos honrados por contribuciones | Amstat News" . magazine.amstat.org . Consultado el 30 de agosto de 2017 .
- ^ "Métodos para matrices de oligonucleótidos Affymetrix" . Bioconductor . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
- ^ Gautier, L .; Cope, L .; Bolstad, BM; Irizarry, RA (10 de febrero de 2004). "affy - análisis de datos de Affymetrix GeneChip a nivel de sonda" . Bioinformática . 20 (3): 307–315. doi : 10.1093 / bioinformatics / btg405 . PMID 14960456 .
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- ^ "Premio de los Presidentes" . Comité de Presidentes de Sociedades de Estadística . Archivado desde el original el 6 de diciembre de 2015 . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
- ^ "Validación de biología compleja: cómo las matrices pueden complementar sus datos de próxima generación" . Seminarios web sobre ciencia . 5 de diciembre de 2012 . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
- ^ "Premio Mortimer Spiegelman - SECCIÓN DE ESTADÍSTICAS APHA" . sites.google.com . Consultado el 30 de agosto de 2017 .
- ^ "Premio Benjamin Franklin" . Bioinformatics.org . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
- ^ "Rafael Irizarry gana el premio Ben Franklin 2017" . Departamento de Bioestadística de la Facultad de Salud Pública de Harvard TH Chan . 11 de abril de 2017. Archivado desde el original el 12 de agosto de 2017 . Consultado el 12 de agosto de 2017 .
- ^ "19 de febrero de 2020: ¡ISCB felicita y presenta a la clase de becarios 2020!" . www.iscb.org . Consultado el 23 de junio de 2020 .