Richard Michael Durbin , FRS , [3] nacido el 30 de diciembre de 1960 , [1] es un biólogo computacional británico . Actualmente es miembro asociado de la facultad en el Wellcome Trust Sanger Institute [18] y profesor de genética en la Universidad de Cambridge . [19] [20] Anteriormente, fue líder de grupo senior en el Wellcome Trust Sanger Institute durante más de 20 años [21] [22] [23] [24] [5] [25] [ citas excesivas ] y una Profesor honorario de genómica computacional en la Universidad de Cambridge . [26]
Richard Durbin | |
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Nació | Richard Michael Durbin 30 de diciembre de 1960 [1] |
Nacionalidad | británico |
alma mater | Universidad de Cambridge (BA, PhD) |
Conocido por |
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Esposos) | [1] |
Premios |
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Carrera científica | |
Campos | |
Instituciones |
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Tesis | Estudios sobre el desarrollo y organización del sistema nervioso de Caenorhabditis elegans (1987) |
Asesor de doctorado | John G. White [6] |
Estudiantes de doctorado | Ewan Birney [7] |
Otros estudiantes notables |
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Sitio web | sanger .ac .uk / personas / directorio / durbin-richard |
Educación
Durbin se educó en The Hall School Hampstead [ cita requerida ] y Highgate School en Londres. [1] Después de competir en la Olimpíada Internacional de Matemáticas de 1978/9 , [27] pasó a estudiar en la Universidad de Cambridge y se graduó en 1982 [28] con un título con honores de segunda clase en el Cambridge Mathematical Tripos . Después de graduarse, continuó sus estudios de doctorado [6] en St John's College, Cambridge [1] estudiando el desarrollo y organización del sistema nervioso de Caenorhabditis elegans [29] mientras trabajaba en el Laboratorio de Biología Molecular (LMB) en Cambridge. , supervisado por John Graham White .
Investigar
Los primeros trabajos de Durbin incluyeron el desarrollo del software del instrumento principal para uno de los primeros detectores de área de cristalografía de rayos X [30] y el microscopio confocal MRC Biorad , junto con contribuciones al modelado neural. [31] [32]
Luego dirigió la informática para el proyecto del genoma de Caenorhabditis elegans , [33] y junto con Jean Thierry-Mieg desarrolló la base de datos del genoma AceDB , que evolucionó hasta convertirse en el recurso web WormBase . Después de esto, jugó un papel importante en la recopilación de datos y la interpretación de la secuencia del genoma humano. [34]
Ha desarrollado numerosos métodos para el análisis de secuencias computacionales . [35] [36] Estos incluyen la búsqueda de genes (por ejemplo, GeneWise) con Ewan Birney [37] y modelos de Hidden Markov para la alineación y coincidencia de proteínas y ácidos nucleicos (por ejemplo, HMMER ) con Sean Eddy y Graeme Mitchison. Un libro de texto estándar Análisis de secuencias biológicas en coautoría con Sean Eddy , Anders Krogh y Graeme Mitchison [2] describe parte de este trabajo. Usando estos métodos, Durbin trabajó con sus colegas para construir una serie de importantes recursos de datos genómicos, incluida la base de datos de familias de proteínas Pfam , [38] la base de datos del genoma Ensembl , [39] y la base de datos de familias de genes TreeFam . [12]
Más recientemente, Durbin ha vuelto a la secuenciación y ha desarrollado enfoques de baja cobertura para la secuenciación del genoma poblacional, aplicado primero a la levadura, [40] [41] y ha sido uno de los líderes en la aplicación de nueva tecnología de secuenciación para estudiar la variación del genoma humano. [42] [43] Durbin actualmente codirige el proyecto internacional 1000 Genomes para caracterizar la variación hasta el 1% de la frecuencia de los alelos como base para la genética humana.
Premios y honores
Durbin fue ganador conjunto del Premio Mullard de la Royal Society en 1994 (por su trabajo en el microscopio confocal ), ganó el Premio Lord Lloyd of Kilgerran de la Fundación para la Ciencia y la Tecnología en 2004 y fue elegido miembro de la Royal Society (FRS) en 2004 [3] y miembro de la Organización Europea de Biología Molecular (EMBO) en 2009. La Royal Society otorgó su Medalla Gabor a Durbin en 2017 por sus contribuciones a la biología computacional. [44]
El certificado de elección de Durbin para la Royal Society dice:
Durbin se distingue por su poderosa contribución a la biología computacional. En particular, jugó un papel de liderazgo en el establecimiento del nuevo campo de la bioinformática. Esto permite el manejo de datos biológicos a una escala sin precedentes, lo que permite que prospere la genómica. Lideró el análisis del genoma de C. elegans y, con Thierry-Mieg, desarrolló el software de base de datos AceDB . En el proyecto internacional del genoma dirigió el análisis de genes codificadores de proteínas. Introdujo herramientas computacionales clave en software y manejo de datos. Su base de datos Pfam permitió la identificación de dominios en nuevas secuencias de proteínas ; utilizó modelos ocultos de Markov a los que, en general, aportó rigor y que condujeron a modelos de covarianza para la secuencia de ARN . [45]
Vida personal
Durbin es hijo de James Durbin y está casado con Julie Ahringer , científica del Instituto Gurdon . Tienen dos hijos, Benjamín y Zoe. [1]
Referencias
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enlaces externos
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