Defendió su tesis doctoral (Kandidat nauk) titulada “Análisis estructural sistemático del progreso científico y tecnológico en la URSS” en 1976. Tras completar su investigación postdoctoral defendió una tesis titulada “Cuestiones lógico-gnoseológicas del progreso científico y tecnológico” en 1989. Ese mismo año se convirtió en profesor y director del Departamento de Filosofía de la Universidad Pedagógica Estatal de Azerbaiyán. Fundó la Universidad "Azerbaiyán" [1]- una universidad privada en Azerbaiyán en 1991 y fue su rector hasta 2006. Desde 1994 dirige el Centro de Investigación “Oriente y Occidente”. El Prof. S. Khalilov estableció la revista sociopolítica internacional "Ipek Yolu" (La ruta de la seda) en 1997 y fue su Editor en Jefe hasta 2005. En 2002 fue elegido Presidente del Presidium de la Asociación de Azerbaiyán. de Filosofía y Ciencias Sociopolíticas (AFSEA). Desde 2003 es Editor Jefe de la Revista “Felsefe ve Sosial-siyasi Elmler” (Filosofía y Ciencias Sociopolíticas). Desde 2006 es miembro del Presidium de la Comisión de Alta Certificación del Presidente de la República de Azerbaiyán. En 2007, el profesor Khalilov fue elegido miembro correspondiente [1] de laAcademia Nacional de Ciencias de Azerbaiyán . Desde 2009 es el presidente del Consejo Científico de la Academia Nacional de Ciencias de Azerbaiyán en Filosofía, Ciencias Políticas y Sociales.
Las investigaciones del profesor Khalilov se centran principalmente en la filosofía de la ciencia , el comparativismo filosófico, la fenomenología , los aspectos filosóficos de las civilizaciones oriental y occidental, la filosofía de Abu Turkhan y la teoría cognitiva.
S. Khalilov fundó y fue el primer líder de la Escuela de Físicos Juveniles en Azerbaiyán en 1972. Fue elegido Presidente de Jóvenes Científicos de la Universidad Pedagógica Estatal de Azerbaiyán en 1981 y, además, en 1988 fue elegido Presidente de Jóvenes Científicos de la Humanidad de Azerbaiyán. Desde 1997 es el presidente del Comité de Premios que lleva el nombre de Bahmaniar (premio otorgado por trabajos sobre filosofía en Azerbaiyán)
El Prof. S. Khalilov fue Miembro del Parlamento de Azerbaiyán y Vicepresidente de la Comisión Permanente "Ciencia y Educación" del Parlamento durante 2000-2005 ( [2] ).