Instituto de Computación e Imágenes Científicas


El Instituto de Computación e Imágenes Científicas (SCI) es un instituto de investigación permanente en la Universidad de Utah que se enfoca en el desarrollo de nuevas técnicas, herramientas y sistemas de computación y visualización científica con aplicaciones primarias para la ingeniería biomédica . [1] [2] El Instituto SCI es conocido en todo el mundo en la comunidad de visualización por las contribuciones de profesores, ex alumnos y personal. [3] Los profesores están asociados principalmente con la Escuela de Computación., Departamento de Bioingeniería, Departamento de Matemáticas y Departamento de Ingeniería Eléctrica e Informática, con profesorado auxiliar en la Facultad de Medicina y la Facultad de Arquitectura .

El Scientific Computing and Imaging Institute comenzó en 1992 como un grupo de investigación en la Escuela de Computación de la Universidad de Utah por Chris Johnson y Rob MacLeod. En 1994, este grupo se convirtió en el Centro de Computación e Imágenes Científicas, y en 2000 el nombre se cambió a Instituto de Computación e Imágenes Científicas (SCI). En 2007, el Instituto SCI recibió fondos de la USTAR para reclutar más profesores en tecnología de imágenes médicas. El Instituto SCI fue reconocido como Centro de Excelencia NVIDIA CUDA en 2008. [4] En 2011, la financiación de USTAR permitió la contratación de profesores para el procesamiento de señales genómicas y la visualización de información. en 2014, Intel se asoció con el SCI Institute para formar el Intel Parallel Computing Center for Scientific Rendering para investigar y desarrollar técnicas de visualización a gran escala e in situ para hardware Intel. [5]

El objetivo general de investigación del Scientific Computing and Imaging Institute es realizar investigaciones impulsadas por aplicaciones en la creación de nuevas técnicas, herramientas y sistemas de computación científica . Dada la proximidad y disponibilidad de las investigaciones realizadas en la Facultad de Medicina de la Universidad de Utah , un foco de aplicación principal es la medicina . Los investigadores del Instituto SCI también aplican técnicas computacionales a subespecialidades científicas y de ingeniería, como dinámica de fluidos , biomecánica , electrofisiología , campos bioeléctricos, visualización científica , computación paralela , problemas inversos y neuroimagen .

Una tomografía computarizada de un torso humano renderizada con ImageVis3D
Datos volumétricos de una aorta etiquetados con regiones de interés utilizando Seg3D y luego representados de forma interactiva en SCIRun .

El Instituto SCI lanza paquetes de software de código abierto para muchos de los proyectos desarrollados por investigadores para que los utilicen las comunidades de visualización científica e imágenes médicas . Todos los proyectos se publican bajo la licencia de software MIT . Los proyectos notables publicados por SCI incluyen:

  • SCIRun : entorno de resolución de problemas (PSE), para el modelado, simulación y visualización de problemas científicos
  • ImageVis3D: aplicación de renderizado de volumen con soporte de visualización de función de transferencia multidimensional
  • Seg3D - herramienta interactiva de segmentación de imágenes
  • ViSUS : flujos de visualización para máxima escalabilidad
  • ShapeWorks : herramienta de análisis estadístico de formas que construye modelos estadísticos compactos basados ​​en puntos de conjuntos de formas similares que no dependen de ninguna parametrización de superficie específica .
  • FluoRender : herramienta de representación interactiva para la visualización de datos de microscopía confocal .
  • VisTrails : sistema de gestión de flujo de trabajo científico .
  • Cleaver - API y aplicación de mallado tetraédrico multimaterial
  • FEBio : solucionador de elementos finitos no lineal diseñado específicamente para aplicaciones biomecánicas
  • VISPACK : biblioteca de C ++ que incluye objetos de matriz, imagen y volumen
  • Teem : colección de bibliotecas para representar, procesar y visualizar datos ráster científicos
  • Manta Interactive Ray Tracer : entorno de trazado de rayos interactivo diseñado para estaciones de trabajo y supercomputadoras

  • David M. Beazley - escribió Python Essential Reference , co-galardonado con el Premio Gordon Bell en 1993 y en 1998
  • Juliana Freire : desarrolló VisTrails , miembro de la Association for Computing Machinery
  • Amy Ashurst Gooch : desarrolló el sombreado de Gooch para una representación realista no fotográfica (NPR) , escribió el primer libro sobre NPR
  • Charles D. Hansen - coeditor de The Visualization Handbook
  • Gordon Kindlmann : desarrolló glifos tensoriales
  • Aaron Lefohn , director de investigación de NVIDIA
  • Miriah Meyer - TED Fellow y MIT Technology Review TR35 listee, pionera en visualización interactiva para investigación básica
  • Erik Reinhard - Científico distinguido en Technicolor Research and Innovation , fundador y editor en jefe de ACM Transactions on Applied Perception
  • Theresa-Marie Rhyne - directora fundadora del Proyecto de Visualización Cartográfica SIGGRAPH y el Centro de Visualización Científica de la Agencia de Protección Ambiental
  • Peter Shirley - Científico distinguido de NVIDIA reconocido por sus contribuciones al trazado de rayos en tiempo real
  • Claudio Silva - presidente del Comité Técnico de Visualización y Gráficos de IEEE Computer Society , desarrolló VisTrails
  • Peter-Pike Sloan : desarrolló el método de renderizado de transferencia de radiancia precalculado
  • Ross Whitaker - director de la Escuela de Computación de la Universidad de Utah y miembro del IEEE

  • Instituto SCI GitHub
  • Instituto de Computación e Imágenes Científicas: una historia

  1. ^ "Instituto de imágenes y computación científica - Inicio" . Consultado el 16 de abril de 2013 .
  2. ^ Lipson, Hod; Kurman, Melba (2013). Fabricado: el nuevo mundo de la impresión 3D . Indianápolis, IN: Wiley. pag. 121. ISBN 978-1118350638.
  3. ^ Shneiderman, Ben. El nuevo ABC de la investigación: lograr colaboraciones innovadoras . Oxford: Prensa de la Universidad de Oxford. pag. 320. ISBN 978-0-19-875883-9.
  4. ^ Humber, Andrew (31 de julio de 2008). "NVIDIA reconoce a la Universidad de Utah como un centro de excelencia de Cuda" . NVIDIA . Consultado el 8 de abril de 2017 .
  5. ^ "Intel® Parallel Computing Center en SCI Institute, Universidad de Utah | Intel® Software" . Zona de desarrolladores Intel . 16 de septiembre de 2014 . Consultado el 8 de abril de 2017 .

Coordenadas : 40 ° 46′3.72 ″ N 111 ° 50′42.00 ″ W / 40.7677000 ° N 111.8450000 ° W / 40,7677000; -111.8450000