Seo hizo su debut profesional con Seongnam Ilwha , habiéndose unido al club en 2002 procedente de la Universidad de Dankook. Aunque permaneció con Seongnam durante tres temporadas, nunca se presentó como un habitual en el nivel senior, haciendo solo tres apariciones en la K-League en este período. Se transfirió al Daegu FC en 2006, pero jugó solo un partido competitivo para el club, en la Copa de la Liga. Para 2007, se mudó al Suwon City FC , que juega en el segundo nivel, la Liga Nacional semiprofesional de Corea . Después de dos temporadas en Suwon, Seo se mudó al FC Gifu de la J2 League japonesa .
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