La caminata secuencial es una técnica que se puede utilizar para resolver varios espectros de RMN 2D . En un experimento 2D, los picos cruzados deben correlacionarse con los núcleos correctos. Usando la marcha secuencial, se pueden asignar los núcleos correctos a sus picos cruzados. Los picos cruzados asignados pueden proporcionar información valiosa, como interacciones espaciales entre núcleos.
En un NOESY de ADN , por ejemplo, cada nucleótido tiene asociado un cambio químico diferente. En general, las A están más aguas abajo, las T están más aguas arriba y las C y G son intermedias. Cada nucleótido tiene protones en el azúcar desoxirribosa, que se pueden asignar mediante caminata secuencial. Para hacer esto, se debe detectar el primer nucleótido de la secuencia. Conocer la secuencia de ADN ayuda, pero en general, el primer nucleótido se puede determinar usando las siguientes reglas.
1. Los protones de 2 'y 2 "de un nucleótido aparecerán en su columna, así como en la columna del siguiente nucleótido en la secuencia. Por ejemplo, en la secuencia CATG, en la columna para C, su propio 2' y se verán protones de 2 ", pero ninguno de los otros nucleótidos. Para A, se verán sus propios protones de 2 'y 2 ", así como los de C.
2. Los grupos metilo en el nucleótido se ven en la columna para el nucleótido que contiene un grupo metilo, así como para el nucleótido que lo precede. Por ejemplo, en CATG, A y T contendrán el pico de metilo correspondiente al grupo metilo en T, pero G no lo hará.
Una vez que se ha encontrado el primer nucleótido, se determina qué nucleótido está al lado porque debe contener los protones 2 'y 2 "del nucleótido anterior. Esto se hace" caminando "a través del espectro. Este proceso se repite secuencialmente hasta que se han asignado todos los nucleótidos.