Las nexinas de clasificación son un gran grupo de proteínas que se localizan en el citoplasma y tienen el potencial de asociarse con la membrana, ya sea a través de su dominio PX de unión a lípidos (un motivo de unión a fosfolípidos ) o mediante interacciones proteína-proteína con complejos proteicos asociados a la membrana [2 ] [3] Se ha demostrado que algunos miembros de esta familia facilitan la clasificación de proteínas .
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![PDB 1h6h EBI.jpg](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///yH5BAEAAAAALAAAAAABAAEAAAIBRAA7) Estructura del dominio PX de p40 (phox) unido a fosfatidilinositol 3-fosfato. [1] |
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PX |
PF00787 |
IPR001683 |
PX |
PDOC50195 |
1h6h / SCOPe / SUPFAM |
57 |
4on3 |
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En los seres humanos, las nexinas de clasificación se transcriben a partir de los siguientes genes:
Genes | Composición de dominio |
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N-terminal | Mediados de 1 | Mediados de 2 | Mediados de 3 | C-terminal |
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SNX1 , SNX2 | Sorting_nexin_N | - | PX | - | BARRA [4] (Vps5) |
SNX4 , SNX7 , SNX8 , SNX30 | - | - | PX | - | BARRA [4] (Vsp5) |
SNX5 , SNX6 , SNX32 | - | - | PX | - | BAR [4] |
SNX9 , SNX18 , SNX33 | SH3 | - | PX | - | BAR [4] (BAR_3_WASP_bdg) [5] |
SNX13 , SNX14 , SNX19 , SNX25 | PXA [6] | RGS | PX | - | Nexin_C |
SNX15 | - | - | PX | - | MIT [7] |
SNX17 , SNX31 | - | - | PX | RA [8] | FERM_M [9] |
SNX23 | kinesin_motor | SMAD_FHA [10] | PX | - | - |
SNX26 | - | - | PX | SH3 | RhoGAP |
SNX27 | PDZ | - | PX | - | REAL ACADEMIA DE BELLAS ARTES |
SNX28 | - | - | PX | SH3 | SH3 |
SNX3 , SNX10 , SNX11 , SNX12 , SNX16 , SNX20 , SNX21 , SNX22 , SNX24 , SNX29 | - | - | PX | - | - |
Las nexinas de clasificación consisten únicamente en un dominio PX (por ejemplo, SNX3) o tienen una estructura modular compuesta por el PX y dominios adicionales .
Un subgrupo de nexinas clasificadoras (que comprende, en humanos, SNX1, SNX2, SNX4, SNX5, SNX6, SNX7, SNX8, SNX9, SNX18, SNX30, SNX32 y SNX33) posee un dominio BAR en su extremo C-terminal. (El dominio BAR de los SNX 1, 2, 4, 7, 8 y 30 está clasificado por pfam como 'Vps5 C terminal like'.)
Aquí se puede ver un ejemplo de una estructura de dominio nexin de clasificación para SNX1:
- NTD - dominio N-terminal
- Dominio PX
- CTD - dominio BAR del terminal C
![](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///yH5BAEAAAAALAAAAAABAAEAAAIBRAA7)
Diagrama esquemático de las estructuras 1D de una nexina de clasificación representativa, la nexina 1 de clasificación (SNX1). NTD = dominio SNX N-terminal, PX = dominio PX, CTD = dominio BAR C-terminal.