La base de datos espectral para compuestos orgánicos ( SDBS ) es una base de datos de búsqueda en línea gratuita alojada por el Instituto Nacional de Ciencia y Tecnología Industrial Avanzada (AIST) en Japón, que contiene datos espectrales para aproximadamente 34.000 moléculas orgánicas. [1] La base de datos está disponible en inglés y en japonés e incluye seis tipos de espectros: espectros láser Raman , espectros de masas de ionización de electrones (EI-MS), espectros infrarrojos por transformada de Fourier (FT-IR), resonancia magnética nuclear de 1 H ( 1 H-NMR) espectros, resonancia magnética nuclear 13 C (13 C-NMR) espectros y espectros de resonancia paramagnética electrónica (EPR). [2] La construcción de la base de datos comenzó en 1982. La mayoría de los espectros fueron adquiridos y registrados en AIST y algunas de las colecciones aún se están actualizando. [3] Desde 1997, se puede acceder a la base de datos de forma gratuita, pero su uso requiere aceptar un descargo de responsabilidad; el número total acumulado de accesos llegó a 550 millones a finales de enero de 2015. [4]
Contenido | |
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Descripción | Espectros Raman, FT-IR, EI-MS, 1 H-NMR, 13 C-NMR y EPR de compuestos orgánicos. |
Contacto | |
Centro de Investigación | Instituto Nacional de Ciencia y Tecnología Industrial Avanzada (AIST), Japón |
Autores | Yamaji, T., Saito, T., Hayamizu, K., Yanagisawa, M. Yamamoto, O. Wasada, N., Someno, K., Kinugasa, S., Tanabe, K., Tamura, T. y Hiraishi, J. |
Fecha de lanzamiento | 1997 |
Acceso | |
Sitio web | http://sdbs.db.aist.go.jp/sdbs/cgi-bin/cre_index.cgi |
Contenido
Espectros láser Raman
La base de datos contiene aproximadamente 3500 espectros Raman. Los espectros se registraron en la región de 4.000 - 0 cm -1 con una longitud de onda de excitación de 4.800 nm y un ancho de rendija de 100-200 micrómetros. Esta colección no se está actualizando. [4]
Espectros de masa de ionización de electrones (EI-MS)
Los espectros EI-MS se midieron en un espectrómetro JEOL JMS-01SG o JEOL JMS-700, por el método de ionización electrónica, con un voltaje de aceleración electrónica de 75 eV y un voltaje de aceleración de iones de 8-10 kV. Se utilizaron los sistemas de entrada directa o de depósito. La precisión del número de masa es 0,5. Esta colección contiene ca. 25.000 espectros EI-MS y se está actualizando. [4]
Espectros infrarrojos de transformada de Fourier (FT-IR)
Los espectros FT-IR se registraron usando un espectrómetro Nicolet 170SX o JASCO FT / IR-410. Para los espectros registrados en el espectrómetro Nicolet, los datos se almacenaron a intervalos de 0,5 cm −1 en la región de 4.000 - 2.000 cm −1 y de 0,25 cm −1 en la región de 2000 - 400 cm −1 y la resolución espectral fue de 0,25 cm. −1 . Para los espectros registrados en el espectrómetro JASCO, la resolución y los intervalos fueron de 0,5 cm -1 . Las muestras de sólidos se prepararon utilizando el método de disco KBr o pasta Nujol , las muestras de líquidos se prepararon con el método de película líquida . Esta colección contiene aproximadamente 54.100 espectros y se está actualizando. [4]
Espectros de RMN de 1 H
Los espectros de 1 H RMN se registraron a una frecuencia de resonancia de 400 MHz con una resolución de 0,0625 Hz oa 90 MHz con una resolución de 0,125 Hz. La adquisición espectral se llevó a cabo utilizando un ángulo de giro de 22,5 a 30,0 grados y un tiempo de repetición de pulso de 30 segundos. [4] Las muestras se prepararon mediante disolución en cloroformo deuterado (CDCl 3 ), óxido de deuterio (D 2 O) o dimetilsulfóxido deuterado (DMSO-d 6 ). [5] Cada espectro va acompañado de una lista de picos con sus respectivas intensidades y cambios químicos expresados en ppm y Hz. La mayoría de los espectros muestran la asignación de picos. Esta colección contiene aproximadamente 15.900 espectros y se está actualizando. [4]
13 C espectros de RMN
El 13 C espectros de RMN se registraron a varios espectrómetros con frecuencias de resonancia que van desde 15 MHz a 100 MHz y una resolución van de 0,025 a 0.045 ppm. Los espectros se adquirieron utilizando un ángulo de cambio de pulso de 22,5 a 45 grados y un tiempo de repetición de pulso de 4 a 7 segundos. [4] Las muestras se prepararon mediante disolución en CDCl 3 , D 2 O o DMSO-d 6 . [5] Cada espectro va acompañado de una lista de los picos observados con sus respectivos cambios químicos en ppm y sus intensidades. La mayoría de los espectros muestran la asignación de picos. Esta colección contiene aproximadamente 14.200 espectros y se está actualizando. [4]
Espectros de resonancia paramagnética de electrones (EPR)
Esta colección contiene aproximadamente 2000 espectros. Las condiciones de medición y la preparación de la muestra se describen para cada espectro en particular. Esta colección dejó de actualizarse en 1987. [4]
Buscando en la base de datos
Búsquedas directas
La base de datos se puede buscar ingresando uno o más de los siguientes parámetros: nombre químico (es posible solicitar coincidencia parcial o total), fórmula molecular , número de diferentes tipos de átomos presentes en la molécula (como un valor único o como un rango de valores), peso molecular (como valor único o como rango de valores), número de registro CAS o número SDBS. En todos los casos, "%" o "*" se pueden utilizar como comodines. El resultado de la búsqueda incluye todos los espectros disponibles para los parámetros de búsqueda ingresados. Los resultados se pueden clasificar por peso molecular, número de carbonos o número de SDBS en orden ascendente o descendente. [6]
Búsquedas inversas
Si se dispone de un espectro de un compuesto químico desconocido, se puede realizar una búsqueda inversa introduciendo los valores del desplazamiento químico, la frecuencia o la masa de los picos en el espectro de RMN, FT-IR o EI-MS, respectivamente. Este tipo de búsqueda proporciona todos los compuestos químicos en la base de datos que tienen las características espectrales ingresadas. [6]
Referencias
- ^ Wagner, AB (2014). "Capítulo 6: Propiedades físicas y espectros". En Currano, J .; Roth, D. (eds.). Información química para químicos: una cartilla . Real Sociedad de Química. págs. 170-171. ISBN 978-1-84973-551-3.
- ^ Tanabe, K .; Hayamizu, K .; Ono, S .; Wasada, N .; Someno, K; Nokana, S .; Inazumi, Y. (1991). "Spectral Database System SDBS en PC con CD-ROM". Ciencias analíticas . 7 (supl.): 711–712.
- ^ "Introducción a la base de datos espectral (SDBS)" . Chemspider . Real Sociedad de Química . Consultado el 19 de diciembre de 2017 .
- ^ a b c d e f g h yo "Introducción a la base de datos espectral (SDBS)" . Base de datos espectral para compuestos orgánicos, SDBS . Instituto Nacional de Ciencia y Tecnología Industrial Avanzada (AIST) . Consultado el 19 de diciembre de 2017 .
- ^ a b Tsai, CS (2002). Introducción a la bioquímica computacional . Nueva York: Wiley-Liss, Inc. págs. 95–98 . ISBN 0-471-40120-X.
- ^ a b "Compuestos SDBS y búsqueda espectral" . Base de datos espectral para compuestos orgánicos, SDBS . Instituto Nacional de Ciencia y Tecnología Industrial Avanzada (AIST) . Consultado el 21 de diciembre de 2017 .
enlaces externos
- Sitio web de SDBS .