Spinal Cord Toolbox (SCT) [1] es un conjunto de herramientas de análisis optimizadas para imágenes de la médula espinal adquiridas con imágenes de resonancia magnética . Las características principales incluyen segmentación, registro y cálculo de métricas anatómicas.
Desarrollador (es) | NeuroPoly |
---|---|
Lanzamiento estable | 3.0.3 / 26 de abril de 2017 |
Repositorio | github |
Escrito en | Pitón |
Sistema operativo | Linux , Mac OS X |
Tamaño | 140 MB |
Disponible en | inglés |
Tipo | Imagen digital |
Licencia | Licencia MIT |
Características
- Propseg Segmentación automática de la médula espinal. [2]
- La plantilla PAM50 es una plantilla anatómica de la médula espinal que cubre toda la médula espinal y el tronco encefálico y está disponible para contrastes de resonancia magnética ponderados en T1, T2 y T2 *. La plantilla PAM50 incluye segmentación probabilística de materia blanca, materia gris, CSF, así como atlas probabilísticos de subregiones de materia gris y vías de materia blanca. [3] [4] La plantilla también incluye la segmentación de los niveles espinales para la evaluación automática de métricas en ubicaciones específicas. [5]
- Un atlas de materia blanca que incluye 29 máscaras de volumen parcial de las que se encuentran extensiones. [6]
Referencias
- ^ De Leener B, Lévy S, Dupont SM, Fonov VS, Stikov N, Louis Collins D, et al. SCT: Spinal Cord Toolbox, un software de código abierto para procesar datos de resonancia magnética de la médula espinal. Neuroimagen. 2017; 145: 24–43. doi: 10.1016 / j.neuroimage.2016.10.009
- ^ De Leener B, Cohen-Adad J, Kadoury S. Segmentación automática de la médula espinal y el canal espinal junto con el etiquetado vertebral. Imágenes médicas, transacciones IEEE en (en prensa). DOI: 10.1109 / TMI.2015.2437192
- ^ Fonov V, Le Troter A, Taso M, De Leener B, Leveque G, Benhamou M, Sdika M, Benali H, Pradat PF, Collins DL, Callot V, Cohen-Adad J. Marco para el promedio integrado de resonancia magnética de la médula espinal materia blanca y gris: La plantilla MNI-Poly-AMU. Neuroimage 2014. DOI: 10.1016 / j.neuroimage.2014.08.057
- ^ De Leener B, Fonov V, Collins DL, Callot V, Stikov N, Cohen-Adad J. PAM50: plantilla multimodal del tronco del encéfalo y la médula espinal compatible con el espacio ICBM152. Actas de la 25ª Reunión Anual del ISMRM, Honolulu, EE. UU. 2017.
- ^ Cadotte DW, Cadotte A, Cohen-Adad J, Flota D, Livne M, Mikulis D, Fehlings MG. Resolver la variabilidad anatómica de la médula espinal cervical humana: una solución para facilitar la obtención de imágenes neuronales avanzadas. Actas de la 22a Reunión Anual del ISMRM, Milán, Italia 2014: 1719.
- ^ Lévy S, Benhamou M, Naaman C, Rainville P, Callot V, Cohen-Adad J. Atlas de materia blanca de la médula espinal humana con estimación del efecto de volumen parcial. Neuroimagen. 2015; 119: 262–271. doi: 10.1016 / j.neuroimage.2015.06.040