SpoT es una proteína bacteriana que hidroliza alarmones , (p) ppGpp , en la respuesta bacteriana estricta . Su actividad hidrolasa es dependiente de Mn2+ con un motivo His-Asp (HD) conservado. En E. coli , la proteína SpoT consta de 693 aminoácidos. SpoT pertenece a la familia de proteínas RSH . Es bifuncional, tiene actividades de hidrolasa y sintasa. Cuando se elimina relA, E. coli todavía puede producir (p)ppGpp por SpoT.
SpoT puede detectar muchas fuentes de estrés por nutrientes además de la inanición de aminoácidos y responder limitando la hidrolasa. La proteína transportadora de acilo (ACP) se une al dominio TGS de SpoT; esta unión probablemente está influenciada por la proporción de ACP no acilado a ACP acilado en la célula. La inanición de ácidos grasos conduce a un cambio en el equilibrio de las dos actividades de SpoT a favor de la síntesis. La hidrolasa de Spot detecta la falta de fosfato para elevar (p) ppGpp, lo que induce IraP, un antiadaptador de RssB que antagoniza la activación de RssB del recambio de RpoS, lo que induce RpoS.