De 1997 a 1999, Susana Werner mantuvo una relación con el futbolista brasileño Ronaldo . Posteriormente se casó con el portero brasileño Júlio César . La pareja tiene dos hijos, Cauet (nacida en 2002) y Giulia (nacida en 2005). [1]
En junio de 2013, a Werner le robaron a punta de pistola después de que detuvieran su automóvil mientras conducía por Fortaleza a altas horas de la noche. [2]