Al principio se conocía con el nombre de Šviesa . En 2003, el club hizo su debut en la primera división lituana. En 2007, el club volvió a la segunda división, y en 2008, este club dejó de existir.
El club fue fundado en 1974 sobre la base de la selección nacional juvenil de Lituania. Hasta 1990 había alrededor de 500 jóvenes entrenando en las instalaciones del club. Después de la independencia de Lituania, las organizaciones deportivas se reestructuraron. En 2001, por iniciativa del empresario Algimantas Breikštas , el club se recreó y se restauró como „Šviesa“. El club jugó en A Lyga entre 2003-2007. Desde la temporada 2004, el club pasó a llamarse FC Vilnius. Después de una confusión con los contratos de los jugadores en 2008, el club no pudo calificar para la licencia A Lyga y se vino abajo. El propietario del club Algimantas Breikštas aparentemente ha perdido interés en el club, dirigiendo su atención para invertir en el ŁKS Łódź.club en Polonia. Uno de los jugadores más notables que jugó para este club fue Paulinho , quien luego pasó a jugar para el Barcelona .