Él era el segundo hijo de Anthony Godwyn de Wookey , Somerset . Ingresó en Magdalen College, Oxford , a la edad de quince años y entre 1604 y 1610 fue demy del colegio. Se graduó BA el 24 de enero de 1607 y procedió MA el 11 de octubre de 1609.
Godwyn se convirtió en el primer miembro del recién fundado Pembroke College, Oxford (1624), se convirtió en capellán del obispo de Bath and Wells y rector de Brightwell , Berkshire (1626-1643).
Godwyn fue un escritor voluminoso, y alrededor de 1614 publicó Florilegium Phrasicon y Romanae Historiae Anthologia (un tratado inglés sobre antigüedades romanas), ambos para uso de la Escuela Abingdon . Estos fueron los únicos libros de texto escolares sobre el tema durante un siglo. También escribió una Sinopsis de las antigüedades hebreas , y en 1625 Moisés y Aarón, o Ritos civiles y eclesiásticos usados por los antiguos hebreos.. En su prefacio a Antigüedades romanas, Godwyn da una imagen de las dificultades de escribir su libro en el ambiente ruidoso del salón de clases. "Si no agrada, atribúyalo a las charlas susurradas de los niños ruidosos entre los que se originó la obra; pero si se aprueba, atribúyalo a los continuos interrogatorios de los niños".