Era hijo de Robert Southwell (fallecido en 1598) de Woodrising, Norfolk , y de Elizabeth Howard , hija mayor de Charles Howard, primer conde de Nottingham , y una dama en espera de la reina Isabel .
Southwell se casó con Margaret Fuller el 27 de marzo de 1618. Robert Herrick escribió un Epithalamium. [2] Sus hijos incluyeron:
Llegó a vivir separado de su primera esposa en compañía de Mary Eden, la hija de un Doctor en Derecho (presumiblemente Thomas Eden LL.D. de Trinity Hall, Cambridge ). Margaret Southwell se quejó en 1634 por su adulterio y su relación con su hermana. [3] Se casó con Margaret Eden en 1637, no tuvieron hijos.